Protein–RNA interactions for Protein: Q92879

CELF1, CUGBP Elav-like family member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF1Q92879 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CELF1Q92879 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CELF1Q92879 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CELF1Q92879 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CELF1Q92879 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CELF1Q92879 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CELF1Q92879 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CELF1Q92879 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CELF1Q92879 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CELF1Q92879 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CELF1Q92879 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CELF1Q92879 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CELF1Q92879 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CELF1Q92879 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CELF1Q92879 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CELF1Q92879 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CELF1Q92879 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CELF1Q92879 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CELF1Q92879 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CELF1Q92879 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CELF1Q92879 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CELF1Q92879 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CELF1Q92879 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CELF1Q92879 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CELF1Q92879 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CELF1Q92879 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CELF1Q92879 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CELF1Q92879 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CELF1Q92879 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CELF1Q92879 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CELF1Q92879 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CELF1Q92879 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CELF1Q92879 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CELF1Q92879 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CELF1Q92879 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CELF1Q92879 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CELF1Q92879 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CELF1Q92879 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CELF1Q92879 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CELF1Q92879 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CELF1Q92879 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CELF1Q92879 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CELF1Q92879 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CELF1Q92879 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CELF1Q92879 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CELF1Q92879 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CELF1Q92879 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CELF1Q92879 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CELF1Q92879 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CELF1Q92879 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CELF1Q92879 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CELF1Q92879 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CELF1Q92879 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CELF1Q92879 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CELF1Q92879 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CELF1Q92879 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CELF1Q92879 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CELF1Q92879 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CELF1Q92879 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CELF1Q92879 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CELF1Q92879 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CELF1Q92879 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CELF1Q92879 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CELF1Q92879 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CELF1Q92879 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CELF1Q92879 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CELF1Q92879 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CELF1Q92879 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CELF1Q92879 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CELF1Q92879 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CELF1Q92879 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CELF1Q92879 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CELF1Q92879 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CELF1Q92879 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CELF1Q92879 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CELF1Q92879 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CELF1Q92879 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CELF1Q92879 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CELF1Q92879 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CELF1Q92879 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CELF1Q92879 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CELF1Q92879 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CELF1Q92879 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CELF1Q92879 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CELF1Q92879 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CELF1Q92879 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CELF1Q92879 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CELF1Q92879 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CELF1Q92879 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CELF1Q92879 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CELF1Q92879 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CELF1Q92879 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CELF1Q92879 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CELF1Q92879 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CELF1Q92879 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CELF1Q92879 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
CELF1Q92879 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CELF1Q92879 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
CELF1Q92879 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
CELF1Q92879 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms