Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXD9

CASKIN1, Caskin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASKIN1Q8WXD9 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
CASKIN1Q8WXD9 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CASKIN1Q8WXD9 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CASKIN1Q8WXD9 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CASKIN1Q8WXD9 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CASKIN1Q8WXD9 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CASKIN1Q8WXD9 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CASKIN1Q8WXD9 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
CASKIN1Q8WXD9 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
CASKIN1Q8WXD9 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CASKIN1Q8WXD9 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CASKIN1Q8WXD9 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CASKIN1Q8WXD9 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CASKIN1Q8WXD9 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CASKIN1Q8WXD9 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
CASKIN1Q8WXD9 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CASKIN1Q8WXD9 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CASKIN1Q8WXD9 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CASKIN1Q8WXD9 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CASKIN1Q8WXD9 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CASKIN1Q8WXD9 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
CASKIN1Q8WXD9 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CASKIN1Q8WXD9 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CASKIN1Q8WXD9 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CASKIN1Q8WXD9 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CASKIN1Q8WXD9 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CASKIN1Q8WXD9 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CASKIN1Q8WXD9 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CASKIN1Q8WXD9 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CASKIN1Q8WXD9 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CASKIN1Q8WXD9 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
CASKIN1Q8WXD9 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CASKIN1Q8WXD9 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CASKIN1Q8WXD9 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CASKIN1Q8WXD9 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CASKIN1Q8WXD9 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CASKIN1Q8WXD9 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CASKIN1Q8WXD9 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CASKIN1Q8WXD9 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
CASKIN1Q8WXD9 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CASKIN1Q8WXD9 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CASKIN1Q8WXD9 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CASKIN1Q8WXD9 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CASKIN1Q8WXD9 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
CASKIN1Q8WXD9 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
CASKIN1Q8WXD9 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CASKIN1Q8WXD9 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CASKIN1Q8WXD9 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CASKIN1Q8WXD9 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CASKIN1Q8WXD9 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CASKIN1Q8WXD9 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CASKIN1Q8WXD9 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CASKIN1Q8WXD9 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CASKIN1Q8WXD9 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
CASKIN1Q8WXD9 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CASKIN1Q8WXD9 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
CASKIN1Q8WXD9 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CASKIN1Q8WXD9 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CASKIN1Q8WXD9 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CASKIN1Q8WXD9 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CASKIN1Q8WXD9 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CASKIN1Q8WXD9 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CASKIN1Q8WXD9 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CASKIN1Q8WXD9 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CASKIN1Q8WXD9 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CASKIN1Q8WXD9 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CASKIN1Q8WXD9 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CASKIN1Q8WXD9 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
CASKIN1Q8WXD9 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CASKIN1Q8WXD9 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CASKIN1Q8WXD9 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CASKIN1Q8WXD9 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CASKIN1Q8WXD9 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CASKIN1Q8WXD9 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CASKIN1Q8WXD9 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CASKIN1Q8WXD9 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CASKIN1Q8WXD9 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CASKIN1Q8WXD9 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CASKIN1Q8WXD9 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CASKIN1Q8WXD9 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CASKIN1Q8WXD9 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CASKIN1Q8WXD9 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CASKIN1Q8WXD9 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CASKIN1Q8WXD9 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CASKIN1Q8WXD9 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
CASKIN1Q8WXD9 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CASKIN1Q8WXD9 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CASKIN1Q8WXD9 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CASKIN1Q8WXD9 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CASKIN1Q8WXD9 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CASKIN1Q8WXD9 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
CASKIN1Q8WXD9 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CASKIN1Q8WXD9 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CASKIN1Q8WXD9 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CASKIN1Q8WXD9 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CASKIN1Q8WXD9 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CASKIN1Q8WXD9 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CASKIN1Q8WXD9 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CASKIN1Q8WXD9 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CASKIN1Q8WXD9 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms