Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHH1

TTLL11, Tubulin polyglutamylase TTLL11, humanhuman

Predictions only

Length 800 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL11Q8NHH1 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TTLL11Q8NHH1 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TTLL11Q8NHH1 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TTLL11Q8NHH1 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TTLL11Q8NHH1 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TTLL11Q8NHH1 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TTLL11Q8NHH1 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TTLL11Q8NHH1 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TTLL11Q8NHH1 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TTLL11Q8NHH1 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TTLL11Q8NHH1 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TTLL11Q8NHH1 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TTLL11Q8NHH1 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TTLL11Q8NHH1 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TTLL11Q8NHH1 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TTLL11Q8NHH1 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TTLL11Q8NHH1 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TTLL11Q8NHH1 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TTLL11Q8NHH1 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TTLL11Q8NHH1 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TTLL11Q8NHH1 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TTLL11Q8NHH1 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TTLL11Q8NHH1 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TTLL11Q8NHH1 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TTLL11Q8NHH1 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TTLL11Q8NHH1 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TTLL11Q8NHH1 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TTLL11Q8NHH1 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TTLL11Q8NHH1 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TTLL11Q8NHH1 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TTLL11Q8NHH1 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TTLL11Q8NHH1 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TTLL11Q8NHH1 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TTLL11Q8NHH1 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TTLL11Q8NHH1 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TTLL11Q8NHH1 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TTLL11Q8NHH1 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TTLL11Q8NHH1 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TTLL11Q8NHH1 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TTLL11Q8NHH1 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TTLL11Q8NHH1 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TTLL11Q8NHH1 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TTLL11Q8NHH1 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TTLL11Q8NHH1 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TTLL11Q8NHH1 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TTLL11Q8NHH1 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TTLL11Q8NHH1 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TTLL11Q8NHH1 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TTLL11Q8NHH1 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TTLL11Q8NHH1 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TTLL11Q8NHH1 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TTLL11Q8NHH1 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TTLL11Q8NHH1 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TTLL11Q8NHH1 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TTLL11Q8NHH1 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TTLL11Q8NHH1 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TTLL11Q8NHH1 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TTLL11Q8NHH1 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TTLL11Q8NHH1 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TTLL11Q8NHH1 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TTLL11Q8NHH1 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TTLL11Q8NHH1 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TTLL11Q8NHH1 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TTLL11Q8NHH1 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TTLL11Q8NHH1 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TTLL11Q8NHH1 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TTLL11Q8NHH1 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TTLL11Q8NHH1 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TTLL11Q8NHH1 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TTLL11Q8NHH1 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TTLL11Q8NHH1 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TTLL11Q8NHH1 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TTLL11Q8NHH1 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TTLL11Q8NHH1 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TTLL11Q8NHH1 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TTLL11Q8NHH1 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TTLL11Q8NHH1 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TTLL11Q8NHH1 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TTLL11Q8NHH1 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TTLL11Q8NHH1 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TTLL11Q8NHH1 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TTLL11Q8NHH1 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TTLL11Q8NHH1 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TTLL11Q8NHH1 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TTLL11Q8NHH1 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TTLL11Q8NHH1 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TTLL11Q8NHH1 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TTLL11Q8NHH1 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TTLL11Q8NHH1 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TTLL11Q8NHH1 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TTLL11Q8NHH1 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TTLL11Q8NHH1 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TTLL11Q8NHH1 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TTLL11Q8NHH1 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TTLL11Q8NHH1 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TTLL11Q8NHH1 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TTLL11Q8NHH1 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TTLL11Q8NHH1 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TTLL11Q8NHH1 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TTLL11Q8NHH1 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms