Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBF6

AVL9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AVL9Q8NBF6 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
AVL9Q8NBF6 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AVL9Q8NBF6 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
AVL9Q8NBF6 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
AVL9Q8NBF6 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
AVL9Q8NBF6 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
AVL9Q8NBF6 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
AVL9Q8NBF6 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
AVL9Q8NBF6 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
AVL9Q8NBF6 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AVL9Q8NBF6 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
AVL9Q8NBF6 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AVL9Q8NBF6 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
AVL9Q8NBF6 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AVL9Q8NBF6 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AVL9Q8NBF6 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AVL9Q8NBF6 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AVL9Q8NBF6 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AVL9Q8NBF6 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AVL9Q8NBF6 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AVL9Q8NBF6 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AVL9Q8NBF6 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
AVL9Q8NBF6 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
AVL9Q8NBF6 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AVL9Q8NBF6 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AVL9Q8NBF6 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
AVL9Q8NBF6 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
AVL9Q8NBF6 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AVL9Q8NBF6 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AVL9Q8NBF6 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AVL9Q8NBF6 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
AVL9Q8NBF6 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
AVL9Q8NBF6 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
AVL9Q8NBF6 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
AVL9Q8NBF6 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
AVL9Q8NBF6 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AVL9Q8NBF6 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
AVL9Q8NBF6 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AVL9Q8NBF6 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AVL9Q8NBF6 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AVL9Q8NBF6 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AVL9Q8NBF6 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AVL9Q8NBF6 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AVL9Q8NBF6 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
AVL9Q8NBF6 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
AVL9Q8NBF6 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
AVL9Q8NBF6 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
AVL9Q8NBF6 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
AVL9Q8NBF6 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
AVL9Q8NBF6 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AVL9Q8NBF6 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AVL9Q8NBF6 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AVL9Q8NBF6 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
AVL9Q8NBF6 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
AVL9Q8NBF6 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AVL9Q8NBF6 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AVL9Q8NBF6 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
AVL9Q8NBF6 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
AVL9Q8NBF6 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
AVL9Q8NBF6 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
AVL9Q8NBF6 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
AVL9Q8NBF6 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
AVL9Q8NBF6 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
AVL9Q8NBF6 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AVL9Q8NBF6 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
AVL9Q8NBF6 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AVL9Q8NBF6 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
AVL9Q8NBF6 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AVL9Q8NBF6 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AVL9Q8NBF6 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AVL9Q8NBF6 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
AVL9Q8NBF6 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AVL9Q8NBF6 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
AVL9Q8NBF6 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AVL9Q8NBF6 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AVL9Q8NBF6 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AVL9Q8NBF6 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AVL9Q8NBF6 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AVL9Q8NBF6 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
AVL9Q8NBF6 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
AVL9Q8NBF6 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
AVL9Q8NBF6 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
AVL9Q8NBF6 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
AVL9Q8NBF6 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
AVL9Q8NBF6 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
AVL9Q8NBF6 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AVL9Q8NBF6 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
AVL9Q8NBF6 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AVL9Q8NBF6 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
AVL9Q8NBF6 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AVL9Q8NBF6 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AVL9Q8NBF6 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AVL9Q8NBF6 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
AVL9Q8NBF6 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
AVL9Q8NBF6 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
AVL9Q8NBF6 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
AVL9Q8NBF6 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AVL9Q8NBF6 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
AVL9Q8NBF6 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
AVL9Q8NBF6 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms