Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.17□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms