Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC84Q86UT8 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC84Q86UT8 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC84Q86UT8 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC84Q86UT8 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC84Q86UT8 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC84Q86UT8 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC84Q86UT8 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC84Q86UT8 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC84Q86UT8 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC84Q86UT8 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC84Q86UT8 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC84Q86UT8 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC84Q86UT8 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC84Q86UT8 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC84Q86UT8 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC84Q86UT8 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC84Q86UT8 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC84Q86UT8 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC84Q86UT8 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC84Q86UT8 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC84Q86UT8 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC84Q86UT8 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC84Q86UT8 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC84Q86UT8 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC84Q86UT8 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC84Q86UT8 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC84Q86UT8 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC84Q86UT8 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC84Q86UT8 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC84Q86UT8 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC84Q86UT8 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC84Q86UT8 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC84Q86UT8 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC84Q86UT8 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC84Q86UT8 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC84Q86UT8 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC84Q86UT8 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC84Q86UT8 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC84Q86UT8 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC84Q86UT8 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC84Q86UT8 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC84Q86UT8 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC84Q86UT8 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC84Q86UT8 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC84Q86UT8 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC84Q86UT8 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC84Q86UT8 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC84Q86UT8 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC84Q86UT8 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC84Q86UT8 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC84Q86UT8 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC84Q86UT8 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC84Q86UT8 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC84Q86UT8 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC84Q86UT8 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC84Q86UT8 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC84Q86UT8 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC84Q86UT8 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC84Q86UT8 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC84Q86UT8 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC84Q86UT8 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC84Q86UT8 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC84Q86UT8 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC84Q86UT8 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC84Q86UT8 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC84Q86UT8 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC84Q86UT8 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC84Q86UT8 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC84Q86UT8 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC84Q86UT8 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC84Q86UT8 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC84Q86UT8 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC84Q86UT8 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC84Q86UT8 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC84Q86UT8 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC84Q86UT8 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC84Q86UT8 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC84Q86UT8 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC84Q86UT8 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC84Q86UT8 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC84Q86UT8 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC84Q86UT8 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC84Q86UT8 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC84Q86UT8 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC84Q86UT8 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC84Q86UT8 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC84Q86UT8 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC84Q86UT8 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC84Q86UT8 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC84Q86UT8 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC84Q86UT8 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC84Q86UT8 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC84Q86UT8 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC84Q86UT8 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC84Q86UT8 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC84Q86UT8 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC84Q86UT8 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC84Q86UT8 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC84Q86UT8 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms