Protein–RNA interactions for Protein: Q71RG4

TMUB2, Transmembrane and ubiquitin-like domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMUB2Q71RG4 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMUB2Q71RG4 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMUB2Q71RG4 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMUB2Q71RG4 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMUB2Q71RG4 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMUB2Q71RG4 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMUB2Q71RG4 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMUB2Q71RG4 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMUB2Q71RG4 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMUB2Q71RG4 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMUB2Q71RG4 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TMUB2Q71RG4 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMUB2Q71RG4 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMUB2Q71RG4 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMUB2Q71RG4 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TMUB2Q71RG4 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMUB2Q71RG4 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMUB2Q71RG4 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMUB2Q71RG4 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMUB2Q71RG4 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMUB2Q71RG4 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMUB2Q71RG4 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TMUB2Q71RG4 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMUB2Q71RG4 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMUB2Q71RG4 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMUB2Q71RG4 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMUB2Q71RG4 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMUB2Q71RG4 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMUB2Q71RG4 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMUB2Q71RG4 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMUB2Q71RG4 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMUB2Q71RG4 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMUB2Q71RG4 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMUB2Q71RG4 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMUB2Q71RG4 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMUB2Q71RG4 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMUB2Q71RG4 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMUB2Q71RG4 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMUB2Q71RG4 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMUB2Q71RG4 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMUB2Q71RG4 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMUB2Q71RG4 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMUB2Q71RG4 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMUB2Q71RG4 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMUB2Q71RG4 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMUB2Q71RG4 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMUB2Q71RG4 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMUB2Q71RG4 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TMUB2Q71RG4 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMUB2Q71RG4 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMUB2Q71RG4 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMUB2Q71RG4 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMUB2Q71RG4 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TMUB2Q71RG4 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMUB2Q71RG4 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMUB2Q71RG4 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMUB2Q71RG4 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMUB2Q71RG4 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMUB2Q71RG4 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMUB2Q71RG4 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMUB2Q71RG4 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMUB2Q71RG4 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMUB2Q71RG4 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMUB2Q71RG4 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMUB2Q71RG4 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMUB2Q71RG4 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMUB2Q71RG4 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMUB2Q71RG4 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TMUB2Q71RG4 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMUB2Q71RG4 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMUB2Q71RG4 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMUB2Q71RG4 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TMUB2Q71RG4 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMUB2Q71RG4 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMUB2Q71RG4 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMUB2Q71RG4 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMUB2Q71RG4 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMUB2Q71RG4 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMUB2Q71RG4 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMUB2Q71RG4 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMUB2Q71RG4 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMUB2Q71RG4 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMUB2Q71RG4 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMUB2Q71RG4 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TMUB2Q71RG4 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMUB2Q71RG4 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMUB2Q71RG4 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMUB2Q71RG4 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMUB2Q71RG4 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMUB2Q71RG4 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMUB2Q71RG4 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMUB2Q71RG4 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMUB2Q71RG4 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMUB2Q71RG4 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMUB2Q71RG4 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMUB2Q71RG4 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMUB2Q71RG4 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMUB2Q71RG4 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMUB2Q71RG4 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMUB2Q71RG4 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms