Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC1

PP13850, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q71RC1 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q71RC1 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q71RC1 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q71RC1 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q71RC1 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q71RC1 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Q71RC1 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q71RC1 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q71RC1 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q71RC1 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q71RC1 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Q71RC1 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q71RC1 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q71RC1 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q71RC1 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q71RC1 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q71RC1 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q71RC1 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q71RC1 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q71RC1 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q71RC1 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q71RC1 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q71RC1 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q71RC1 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q71RC1 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q71RC1 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q71RC1 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Q71RC1 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Q71RC1 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q71RC1 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q71RC1 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q71RC1 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q71RC1 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q71RC1 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q71RC1 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q71RC1 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q71RC1 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q71RC1 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q71RC1 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q71RC1 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q71RC1 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q71RC1 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q71RC1 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q71RC1 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q71RC1 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q71RC1 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q71RC1 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q71RC1 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q71RC1 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q71RC1 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q71RC1 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q71RC1 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q71RC1 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q71RC1 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q71RC1 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q71RC1 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q71RC1 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q71RC1 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q71RC1 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Q71RC1 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q71RC1 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q71RC1 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Q71RC1 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q71RC1 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q71RC1 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q71RC1 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q71RC1 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q71RC1 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q71RC1 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q71RC1 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q71RC1 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q71RC1 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q71RC1 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q71RC1 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q71RC1 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q71RC1 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q71RC1 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q71RC1 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q71RC1 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q71RC1 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q71RC1 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q71RC1 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q71RC1 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q71RC1 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q71RC1 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q71RC1 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q71RC1 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q71RC1 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q71RC1 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q71RC1 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q71RC1 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Q71RC1 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q71RC1 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q71RC1 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q71RC1 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Q71RC1 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q71RC1 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q71RC1 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Q71RC1 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Q71RC1 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms