Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT12

UBR3, E3 ubiquitin-protein ligase UBR3, humanhuman

Predictions only

Length 1,888 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBR3Q6ZT12 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
UBR3Q6ZT12 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
UBR3Q6ZT12 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
UBR3Q6ZT12 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
UBR3Q6ZT12 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
UBR3Q6ZT12 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
UBR3Q6ZT12 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
UBR3Q6ZT12 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
UBR3Q6ZT12 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
UBR3Q6ZT12 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBR3Q6ZT12 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBR3Q6ZT12 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBR3Q6ZT12 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBR3Q6ZT12 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBR3Q6ZT12 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBR3Q6ZT12 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBR3Q6ZT12 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
UBR3Q6ZT12 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBR3Q6ZT12 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBR3Q6ZT12 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBR3Q6ZT12 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBR3Q6ZT12 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBR3Q6ZT12 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBR3Q6ZT12 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBR3Q6ZT12 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBR3Q6ZT12 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBR3Q6ZT12 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBR3Q6ZT12 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBR3Q6ZT12 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
UBR3Q6ZT12 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBR3Q6ZT12 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBR3Q6ZT12 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBR3Q6ZT12 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBR3Q6ZT12 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBR3Q6ZT12 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
UBR3Q6ZT12 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBR3Q6ZT12 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBR3Q6ZT12 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBR3Q6ZT12 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBR3Q6ZT12 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBR3Q6ZT12 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBR3Q6ZT12 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBR3Q6ZT12 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBR3Q6ZT12 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBR3Q6ZT12 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBR3Q6ZT12 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBR3Q6ZT12 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBR3Q6ZT12 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBR3Q6ZT12 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBR3Q6ZT12 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBR3Q6ZT12 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBR3Q6ZT12 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBR3Q6ZT12 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBR3Q6ZT12 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBR3Q6ZT12 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBR3Q6ZT12 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBR3Q6ZT12 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBR3Q6ZT12 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBR3Q6ZT12 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBR3Q6ZT12 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBR3Q6ZT12 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBR3Q6ZT12 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBR3Q6ZT12 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBR3Q6ZT12 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBR3Q6ZT12 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBR3Q6ZT12 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBR3Q6ZT12 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBR3Q6ZT12 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBR3Q6ZT12 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBR3Q6ZT12 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBR3Q6ZT12 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
UBR3Q6ZT12 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBR3Q6ZT12 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
UBR3Q6ZT12 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
UBR3Q6ZT12 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
UBR3Q6ZT12 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBR3Q6ZT12 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBR3Q6ZT12 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
UBR3Q6ZT12 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBR3Q6ZT12 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBR3Q6ZT12 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBR3Q6ZT12 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBR3Q6ZT12 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBR3Q6ZT12 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
UBR3Q6ZT12 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
UBR3Q6ZT12 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
UBR3Q6ZT12 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBR3Q6ZT12 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBR3Q6ZT12 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBR3Q6ZT12 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBR3Q6ZT12 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBR3Q6ZT12 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBR3Q6ZT12 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBR3Q6ZT12 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBR3Q6ZT12 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
UBR3Q6ZT12 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBR3Q6ZT12 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBR3Q6ZT12 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBR3Q6ZT12 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBR3Q6ZT12 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms