Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSI9

CAPN12, Calpain-12, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN12Q6ZSI9 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CAPN12Q6ZSI9 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CAPN12Q6ZSI9 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CAPN12Q6ZSI9 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CAPN12Q6ZSI9 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CAPN12Q6ZSI9 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CAPN12Q6ZSI9 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CAPN12Q6ZSI9 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CAPN12Q6ZSI9 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CAPN12Q6ZSI9 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CAPN12Q6ZSI9 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CAPN12Q6ZSI9 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CAPN12Q6ZSI9 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CAPN12Q6ZSI9 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CAPN12Q6ZSI9 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CAPN12Q6ZSI9 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CAPN12Q6ZSI9 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CAPN12Q6ZSI9 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CAPN12Q6ZSI9 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CAPN12Q6ZSI9 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CAPN12Q6ZSI9 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CAPN12Q6ZSI9 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CAPN12Q6ZSI9 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CAPN12Q6ZSI9 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CAPN12Q6ZSI9 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CAPN12Q6ZSI9 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CAPN12Q6ZSI9 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CAPN12Q6ZSI9 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CAPN12Q6ZSI9 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CAPN12Q6ZSI9 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CAPN12Q6ZSI9 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CAPN12Q6ZSI9 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CAPN12Q6ZSI9 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CAPN12Q6ZSI9 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CAPN12Q6ZSI9 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CAPN12Q6ZSI9 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CAPN12Q6ZSI9 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CAPN12Q6ZSI9 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CAPN12Q6ZSI9 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CAPN12Q6ZSI9 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CAPN12Q6ZSI9 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CAPN12Q6ZSI9 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CAPN12Q6ZSI9 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CAPN12Q6ZSI9 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CAPN12Q6ZSI9 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CAPN12Q6ZSI9 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CAPN12Q6ZSI9 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CAPN12Q6ZSI9 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CAPN12Q6ZSI9 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CAPN12Q6ZSI9 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CAPN12Q6ZSI9 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CAPN12Q6ZSI9 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CAPN12Q6ZSI9 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CAPN12Q6ZSI9 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CAPN12Q6ZSI9 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CAPN12Q6ZSI9 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CAPN12Q6ZSI9 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CAPN12Q6ZSI9 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CAPN12Q6ZSI9 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CAPN12Q6ZSI9 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CAPN12Q6ZSI9 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CAPN12Q6ZSI9 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CAPN12Q6ZSI9 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CAPN12Q6ZSI9 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CAPN12Q6ZSI9 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CAPN12Q6ZSI9 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CAPN12Q6ZSI9 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CAPN12Q6ZSI9 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CAPN12Q6ZSI9 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CAPN12Q6ZSI9 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CAPN12Q6ZSI9 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CAPN12Q6ZSI9 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CAPN12Q6ZSI9 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CAPN12Q6ZSI9 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CAPN12Q6ZSI9 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CAPN12Q6ZSI9 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CAPN12Q6ZSI9 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CAPN12Q6ZSI9 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CAPN12Q6ZSI9 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CAPN12Q6ZSI9 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CAPN12Q6ZSI9 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CAPN12Q6ZSI9 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CAPN12Q6ZSI9 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CAPN12Q6ZSI9 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CAPN12Q6ZSI9 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CAPN12Q6ZSI9 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CAPN12Q6ZSI9 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CAPN12Q6ZSI9 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CAPN12Q6ZSI9 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CAPN12Q6ZSI9 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CAPN12Q6ZSI9 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CAPN12Q6ZSI9 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CAPN12Q6ZSI9 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CAPN12Q6ZSI9 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CAPN12Q6ZSI9 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CAPN12Q6ZSI9 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CAPN12Q6ZSI9 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CAPN12Q6ZSI9 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CAPN12Q6ZSI9 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CAPN12Q6ZSI9 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms