Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2S7

TTC41P, Putative tetratricopeptide repeat protein 41, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC41PQ6P2S7 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TTC41PQ6P2S7 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TTC41PQ6P2S7 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TTC41PQ6P2S7 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TTC41PQ6P2S7 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TTC41PQ6P2S7 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TTC41PQ6P2S7 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TTC41PQ6P2S7 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TTC41PQ6P2S7 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TTC41PQ6P2S7 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TTC41PQ6P2S7 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TTC41PQ6P2S7 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TTC41PQ6P2S7 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TTC41PQ6P2S7 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TTC41PQ6P2S7 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TTC41PQ6P2S7 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TTC41PQ6P2S7 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TTC41PQ6P2S7 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TTC41PQ6P2S7 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TTC41PQ6P2S7 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TTC41PQ6P2S7 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TTC41PQ6P2S7 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TTC41PQ6P2S7 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TTC41PQ6P2S7 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TTC41PQ6P2S7 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TTC41PQ6P2S7 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TTC41PQ6P2S7 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TTC41PQ6P2S7 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TTC41PQ6P2S7 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TTC41PQ6P2S7 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TTC41PQ6P2S7 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TTC41PQ6P2S7 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TTC41PQ6P2S7 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TTC41PQ6P2S7 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TTC41PQ6P2S7 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TTC41PQ6P2S7 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TTC41PQ6P2S7 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TTC41PQ6P2S7 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TTC41PQ6P2S7 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TTC41PQ6P2S7 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TTC41PQ6P2S7 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TTC41PQ6P2S7 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TTC41PQ6P2S7 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TTC41PQ6P2S7 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TTC41PQ6P2S7 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TTC41PQ6P2S7 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TTC41PQ6P2S7 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TTC41PQ6P2S7 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TTC41PQ6P2S7 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TTC41PQ6P2S7 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TTC41PQ6P2S7 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TTC41PQ6P2S7 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TTC41PQ6P2S7 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TTC41PQ6P2S7 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TTC41PQ6P2S7 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
TTC41PQ6P2S7 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TTC41PQ6P2S7 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TTC41PQ6P2S7 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TTC41PQ6P2S7 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TTC41PQ6P2S7 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TTC41PQ6P2S7 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TTC41PQ6P2S7 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TTC41PQ6P2S7 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TTC41PQ6P2S7 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TTC41PQ6P2S7 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TTC41PQ6P2S7 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TTC41PQ6P2S7 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TTC41PQ6P2S7 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TTC41PQ6P2S7 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TTC41PQ6P2S7 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TTC41PQ6P2S7 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TTC41PQ6P2S7 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TTC41PQ6P2S7 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TTC41PQ6P2S7 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TTC41PQ6P2S7 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TTC41PQ6P2S7 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TTC41PQ6P2S7 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TTC41PQ6P2S7 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TTC41PQ6P2S7 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TTC41PQ6P2S7 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TTC41PQ6P2S7 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TTC41PQ6P2S7 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TTC41PQ6P2S7 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TTC41PQ6P2S7 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTC41PQ6P2S7 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTC41PQ6P2S7 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTC41PQ6P2S7 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTC41PQ6P2S7 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTC41PQ6P2S7 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTC41PQ6P2S7 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTC41PQ6P2S7 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTC41PQ6P2S7 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTC41PQ6P2S7 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTC41PQ6P2S7 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTC41PQ6P2S7 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTC41PQ6P2S7 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTC41PQ6P2S7 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TTC41PQ6P2S7 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTC41PQ6P2S7 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTC41PQ6P2S7 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms