Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2E9

EDC4, Enhancer of mRNA-decapping protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDC4Q6P2E9 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
EDC4Q6P2E9 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EDC4Q6P2E9 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EDC4Q6P2E9 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EDC4Q6P2E9 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
EDC4Q6P2E9 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EDC4Q6P2E9 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
EDC4Q6P2E9 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
EDC4Q6P2E9 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
EDC4Q6P2E9 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
EDC4Q6P2E9 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
EDC4Q6P2E9 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
EDC4Q6P2E9 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
EDC4Q6P2E9 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
EDC4Q6P2E9 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EDC4Q6P2E9 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EDC4Q6P2E9 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
EDC4Q6P2E9 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
EDC4Q6P2E9 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
EDC4Q6P2E9 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
EDC4Q6P2E9 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
EDC4Q6P2E9 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
EDC4Q6P2E9 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
EDC4Q6P2E9 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EDC4Q6P2E9 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EDC4Q6P2E9 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EDC4Q6P2E9 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
EDC4Q6P2E9 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
EDC4Q6P2E9 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
EDC4Q6P2E9 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EDC4Q6P2E9 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EDC4Q6P2E9 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
EDC4Q6P2E9 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
EDC4Q6P2E9 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
EDC4Q6P2E9 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
EDC4Q6P2E9 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EDC4Q6P2E9 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
EDC4Q6P2E9 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
EDC4Q6P2E9 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EDC4Q6P2E9 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
EDC4Q6P2E9 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EDC4Q6P2E9 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EDC4Q6P2E9 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
EDC4Q6P2E9 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
EDC4Q6P2E9 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
EDC4Q6P2E9 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
EDC4Q6P2E9 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
EDC4Q6P2E9 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EDC4Q6P2E9 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
EDC4Q6P2E9 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EDC4Q6P2E9 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
EDC4Q6P2E9 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
EDC4Q6P2E9 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
EDC4Q6P2E9 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
EDC4Q6P2E9 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EDC4Q6P2E9 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EDC4Q6P2E9 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EDC4Q6P2E9 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EDC4Q6P2E9 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EDC4Q6P2E9 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
EDC4Q6P2E9 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
EDC4Q6P2E9 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EDC4Q6P2E9 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EDC4Q6P2E9 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
EDC4Q6P2E9 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
EDC4Q6P2E9 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
EDC4Q6P2E9 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
EDC4Q6P2E9 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
EDC4Q6P2E9 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EDC4Q6P2E9 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EDC4Q6P2E9 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EDC4Q6P2E9 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
EDC4Q6P2E9 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
EDC4Q6P2E9 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EDC4Q6P2E9 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
EDC4Q6P2E9 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EDC4Q6P2E9 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
EDC4Q6P2E9 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
EDC4Q6P2E9 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
EDC4Q6P2E9 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
EDC4Q6P2E9 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
EDC4Q6P2E9 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
EDC4Q6P2E9 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
EDC4Q6P2E9 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
EDC4Q6P2E9 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
EDC4Q6P2E9 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
EDC4Q6P2E9 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
EDC4Q6P2E9 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
EDC4Q6P2E9 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
EDC4Q6P2E9 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
EDC4Q6P2E9 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
EDC4Q6P2E9 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
EDC4Q6P2E9 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
EDC4Q6P2E9 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
EDC4Q6P2E9 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
EDC4Q6P2E9 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
EDC4Q6P2E9 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
EDC4Q6P2E9 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
EDC4Q6P2E9 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
EDC4Q6P2E9 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms