Protein–RNA interactions for Protein: Q6GQQ9

OTUD7B, OTU domain-containing protein 7B, humanhuman

Predictions only

Length 843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD7BQ6GQQ9 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
OTUD7BQ6GQQ9 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
OTUD7BQ6GQQ9 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
OTUD7BQ6GQQ9 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
OTUD7BQ6GQQ9 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
OTUD7BQ6GQQ9 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
OTUD7BQ6GQQ9 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
OTUD7BQ6GQQ9 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
OTUD7BQ6GQQ9 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
OTUD7BQ6GQQ9 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
OTUD7BQ6GQQ9 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
OTUD7BQ6GQQ9 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
OTUD7BQ6GQQ9 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
OTUD7BQ6GQQ9 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
OTUD7BQ6GQQ9 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
OTUD7BQ6GQQ9 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
OTUD7BQ6GQQ9 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
OTUD7BQ6GQQ9 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
OTUD7BQ6GQQ9 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
OTUD7BQ6GQQ9 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
OTUD7BQ6GQQ9 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
OTUD7BQ6GQQ9 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
OTUD7BQ6GQQ9 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
OTUD7BQ6GQQ9 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
OTUD7BQ6GQQ9 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
OTUD7BQ6GQQ9 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
OTUD7BQ6GQQ9 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
OTUD7BQ6GQQ9 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
OTUD7BQ6GQQ9 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
OTUD7BQ6GQQ9 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
OTUD7BQ6GQQ9 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
OTUD7BQ6GQQ9 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
OTUD7BQ6GQQ9 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
OTUD7BQ6GQQ9 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
OTUD7BQ6GQQ9 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
OTUD7BQ6GQQ9 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
OTUD7BQ6GQQ9 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
OTUD7BQ6GQQ9 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
OTUD7BQ6GQQ9 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
OTUD7BQ6GQQ9 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
OTUD7BQ6GQQ9 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
OTUD7BQ6GQQ9 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
OTUD7BQ6GQQ9 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
OTUD7BQ6GQQ9 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
OTUD7BQ6GQQ9 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
OTUD7BQ6GQQ9 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
OTUD7BQ6GQQ9 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
OTUD7BQ6GQQ9 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
OTUD7BQ6GQQ9 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
OTUD7BQ6GQQ9 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
OTUD7BQ6GQQ9 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
OTUD7BQ6GQQ9 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
OTUD7BQ6GQQ9 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
OTUD7BQ6GQQ9 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
OTUD7BQ6GQQ9 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
OTUD7BQ6GQQ9 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
OTUD7BQ6GQQ9 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
OTUD7BQ6GQQ9 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
OTUD7BQ6GQQ9 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
OTUD7BQ6GQQ9 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
OTUD7BQ6GQQ9 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
OTUD7BQ6GQQ9 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
OTUD7BQ6GQQ9 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
OTUD7BQ6GQQ9 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
OTUD7BQ6GQQ9 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
OTUD7BQ6GQQ9 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
OTUD7BQ6GQQ9 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
OTUD7BQ6GQQ9 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
OTUD7BQ6GQQ9 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
OTUD7BQ6GQQ9 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
OTUD7BQ6GQQ9 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
OTUD7BQ6GQQ9 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
OTUD7BQ6GQQ9 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
OTUD7BQ6GQQ9 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
OTUD7BQ6GQQ9 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
OTUD7BQ6GQQ9 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
OTUD7BQ6GQQ9 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
OTUD7BQ6GQQ9 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
OTUD7BQ6GQQ9 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
OTUD7BQ6GQQ9 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
OTUD7BQ6GQQ9 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
OTUD7BQ6GQQ9 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
OTUD7BQ6GQQ9 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
OTUD7BQ6GQQ9 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
OTUD7BQ6GQQ9 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
OTUD7BQ6GQQ9 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
OTUD7BQ6GQQ9 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
OTUD7BQ6GQQ9 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
OTUD7BQ6GQQ9 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
OTUD7BQ6GQQ9 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
OTUD7BQ6GQQ9 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
OTUD7BQ6GQQ9 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
OTUD7BQ6GQQ9 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
OTUD7BQ6GQQ9 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
OTUD7BQ6GQQ9 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
OTUD7BQ6GQQ9 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
OTUD7BQ6GQQ9 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
OTUD7BQ6GQQ9 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
OTUD7BQ6GQQ9 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
OTUD7BQ6GQQ9 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms