Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXU9

C9orf84, Uncharacterized protein C9orf84, humanhuman

Predictions only

Length 1,444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf84Q5VXU9 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
C9orf84Q5VXU9 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
C9orf84Q5VXU9 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
C9orf84Q5VXU9 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
C9orf84Q5VXU9 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
C9orf84Q5VXU9 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
C9orf84Q5VXU9 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
C9orf84Q5VXU9 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
C9orf84Q5VXU9 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
C9orf84Q5VXU9 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
C9orf84Q5VXU9 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
C9orf84Q5VXU9 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
C9orf84Q5VXU9 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
C9orf84Q5VXU9 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
C9orf84Q5VXU9 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
C9orf84Q5VXU9 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
C9orf84Q5VXU9 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
C9orf84Q5VXU9 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
C9orf84Q5VXU9 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
C9orf84Q5VXU9 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
C9orf84Q5VXU9 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
C9orf84Q5VXU9 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
C9orf84Q5VXU9 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
C9orf84Q5VXU9 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
C9orf84Q5VXU9 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
C9orf84Q5VXU9 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
C9orf84Q5VXU9 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
C9orf84Q5VXU9 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
C9orf84Q5VXU9 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
C9orf84Q5VXU9 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
C9orf84Q5VXU9 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
C9orf84Q5VXU9 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
C9orf84Q5VXU9 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
C9orf84Q5VXU9 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
C9orf84Q5VXU9 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
C9orf84Q5VXU9 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
C9orf84Q5VXU9 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
C9orf84Q5VXU9 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
C9orf84Q5VXU9 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
C9orf84Q5VXU9 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
C9orf84Q5VXU9 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
C9orf84Q5VXU9 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
C9orf84Q5VXU9 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
C9orf84Q5VXU9 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
C9orf84Q5VXU9 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
C9orf84Q5VXU9 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
C9orf84Q5VXU9 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
C9orf84Q5VXU9 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
C9orf84Q5VXU9 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
C9orf84Q5VXU9 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
C9orf84Q5VXU9 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
C9orf84Q5VXU9 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
C9orf84Q5VXU9 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
C9orf84Q5VXU9 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
C9orf84Q5VXU9 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
C9orf84Q5VXU9 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
C9orf84Q5VXU9 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
C9orf84Q5VXU9 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
C9orf84Q5VXU9 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
C9orf84Q5VXU9 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
C9orf84Q5VXU9 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
C9orf84Q5VXU9 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
C9orf84Q5VXU9 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
C9orf84Q5VXU9 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
C9orf84Q5VXU9 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
C9orf84Q5VXU9 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
C9orf84Q5VXU9 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
C9orf84Q5VXU9 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
C9orf84Q5VXU9 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
C9orf84Q5VXU9 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
C9orf84Q5VXU9 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
C9orf84Q5VXU9 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
C9orf84Q5VXU9 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
C9orf84Q5VXU9 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
C9orf84Q5VXU9 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
C9orf84Q5VXU9 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
C9orf84Q5VXU9 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
C9orf84Q5VXU9 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
C9orf84Q5VXU9 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
C9orf84Q5VXU9 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
C9orf84Q5VXU9 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
C9orf84Q5VXU9 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
C9orf84Q5VXU9 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
C9orf84Q5VXU9 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
C9orf84Q5VXU9 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
C9orf84Q5VXU9 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
C9orf84Q5VXU9 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
C9orf84Q5VXU9 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
C9orf84Q5VXU9 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
C9orf84Q5VXU9 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
C9orf84Q5VXU9 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
C9orf84Q5VXU9 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
C9orf84Q5VXU9 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
C9orf84Q5VXU9 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
C9orf84Q5VXU9 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
C9orf84Q5VXU9 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
C9orf84Q5VXU9 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
C9orf84Q5VXU9 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
C9orf84Q5VXU9 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
C9orf84Q5VXU9 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms