Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUD6

FAM69B, Protein FAM69B, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM69BQ5VUD6 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FAM69BQ5VUD6 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FAM69BQ5VUD6 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FAM69BQ5VUD6 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAM69BQ5VUD6 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAM69BQ5VUD6 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAM69BQ5VUD6 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAM69BQ5VUD6 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAM69BQ5VUD6 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAM69BQ5VUD6 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAM69BQ5VUD6 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAM69BQ5VUD6 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAM69BQ5VUD6 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAM69BQ5VUD6 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAM69BQ5VUD6 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAM69BQ5VUD6 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
FAM69BQ5VUD6 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAM69BQ5VUD6 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAM69BQ5VUD6 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAM69BQ5VUD6 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAM69BQ5VUD6 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
FAM69BQ5VUD6 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAM69BQ5VUD6 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAM69BQ5VUD6 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAM69BQ5VUD6 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAM69BQ5VUD6 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAM69BQ5VUD6 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAM69BQ5VUD6 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
FAM69BQ5VUD6 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAM69BQ5VUD6 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAM69BQ5VUD6 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAM69BQ5VUD6 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
FAM69BQ5VUD6 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
FAM69BQ5VUD6 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
FAM69BQ5VUD6 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
FAM69BQ5VUD6 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
FAM69BQ5VUD6 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
FAM69BQ5VUD6 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
FAM69BQ5VUD6 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FAM69BQ5VUD6 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FAM69BQ5VUD6 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FAM69BQ5VUD6 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FAM69BQ5VUD6 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FAM69BQ5VUD6 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FAM69BQ5VUD6 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FAM69BQ5VUD6 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FAM69BQ5VUD6 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FAM69BQ5VUD6 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FAM69BQ5VUD6 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FAM69BQ5VUD6 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FAM69BQ5VUD6 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FAM69BQ5VUD6 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FAM69BQ5VUD6 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FAM69BQ5VUD6 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
FAM69BQ5VUD6 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FAM69BQ5VUD6 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FAM69BQ5VUD6 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FAM69BQ5VUD6 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FAM69BQ5VUD6 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FAM69BQ5VUD6 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FAM69BQ5VUD6 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FAM69BQ5VUD6 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FAM69BQ5VUD6 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FAM69BQ5VUD6 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FAM69BQ5VUD6 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FAM69BQ5VUD6 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FAM69BQ5VUD6 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FAM69BQ5VUD6 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FAM69BQ5VUD6 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FAM69BQ5VUD6 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FAM69BQ5VUD6 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FAM69BQ5VUD6 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FAM69BQ5VUD6 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
FAM69BQ5VUD6 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FAM69BQ5VUD6 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FAM69BQ5VUD6 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FAM69BQ5VUD6 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FAM69BQ5VUD6 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
FAM69BQ5VUD6 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
FAM69BQ5VUD6 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
FAM69BQ5VUD6 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FAM69BQ5VUD6 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FAM69BQ5VUD6 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FAM69BQ5VUD6 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FAM69BQ5VUD6 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FAM69BQ5VUD6 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FAM69BQ5VUD6 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FAM69BQ5VUD6 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FAM69BQ5VUD6 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FAM69BQ5VUD6 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FAM69BQ5VUD6 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FAM69BQ5VUD6 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FAM69BQ5VUD6 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FAM69BQ5VUD6 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FAM69BQ5VUD6 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FAM69BQ5VUD6 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
FAM69BQ5VUD6 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FAM69BQ5VUD6 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FAM69BQ5VUD6 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FAM69BQ5VUD6 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms