Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT5

MYOM3, Myomesin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYOM3Q5VTT5 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
MYOM3Q5VTT5 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
MYOM3Q5VTT5 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
MYOM3Q5VTT5 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
MYOM3Q5VTT5 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
MYOM3Q5VTT5 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
MYOM3Q5VTT5 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
MYOM3Q5VTT5 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
MYOM3Q5VTT5 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
MYOM3Q5VTT5 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
MYOM3Q5VTT5 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
MYOM3Q5VTT5 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
MYOM3Q5VTT5 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
MYOM3Q5VTT5 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
MYOM3Q5VTT5 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
MYOM3Q5VTT5 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
MYOM3Q5VTT5 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
MYOM3Q5VTT5 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
MYOM3Q5VTT5 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
MYOM3Q5VTT5 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
MYOM3Q5VTT5 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
MYOM3Q5VTT5 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
MYOM3Q5VTT5 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MYOM3Q5VTT5 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
MYOM3Q5VTT5 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MYOM3Q5VTT5 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MYOM3Q5VTT5 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MYOM3Q5VTT5 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MYOM3Q5VTT5 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
MYOM3Q5VTT5 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
MYOM3Q5VTT5 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC28.31■■■□□ 2.12
MYOM3Q5VTT5 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
MYOM3Q5VTT5 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
MYOM3Q5VTT5 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MYOM3Q5VTT5 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
MYOM3Q5VTT5 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MYOM3Q5VTT5 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
MYOM3Q5VTT5 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MYOM3Q5VTT5 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MYOM3Q5VTT5 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MYOM3Q5VTT5 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
MYOM3Q5VTT5 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MYOM3Q5VTT5 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
MYOM3Q5VTT5 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
MYOM3Q5VTT5 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
MYOM3Q5VTT5 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
MYOM3Q5VTT5 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC28.3■■■□□ 2.12
MYOM3Q5VTT5 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
MYOM3Q5VTT5 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MYOM3Q5VTT5 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MYOM3Q5VTT5 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MYOM3Q5VTT5 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MYOM3Q5VTT5 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MYOM3Q5VTT5 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MYOM3Q5VTT5 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MYOM3Q5VTT5 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MYOM3Q5VTT5 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
MYOM3Q5VTT5 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MYOM3Q5VTT5 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MYOM3Q5VTT5 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MYOM3Q5VTT5 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
MYOM3Q5VTT5 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
MYOM3Q5VTT5 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
MYOM3Q5VTT5 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MYOM3Q5VTT5 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
MYOM3Q5VTT5 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
MYOM3Q5VTT5 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
MYOM3Q5VTT5 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
MYOM3Q5VTT5 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
MYOM3Q5VTT5 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
MYOM3Q5VTT5 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MYOM3Q5VTT5 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MYOM3Q5VTT5 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MYOM3Q5VTT5 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
MYOM3Q5VTT5 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC28.28■■■□□ 2.12
MYOM3Q5VTT5 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MYOM3Q5VTT5 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MYOM3Q5VTT5 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MYOM3Q5VTT5 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MYOM3Q5VTT5 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MYOM3Q5VTT5 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC28.28■■■□□ 2.12
MYOM3Q5VTT5 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
MYOM3Q5VTT5 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
MYOM3Q5VTT5 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
MYOM3Q5VTT5 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
MYOM3Q5VTT5 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
MYOM3Q5VTT5 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MYOM3Q5VTT5 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MYOM3Q5VTT5 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MYOM3Q5VTT5 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
MYOM3Q5VTT5 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
MYOM3Q5VTT5 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MYOM3Q5VTT5 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MYOM3Q5VTT5 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
MYOM3Q5VTT5 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MYOM3Q5VTT5 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
MYOM3Q5VTT5 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
MYOM3Q5VTT5 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
MYOM3Q5VTT5 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
MYOM3Q5VTT5 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms