Protein–RNA interactions for Protein: Q16881

TXNRD1, Thioredoxin reductase 1, cytoplasmic, humanhuman

Predictions only

Length 649 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNRD1Q16881 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TXNRD1Q16881 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TXNRD1Q16881 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TXNRD1Q16881 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
TXNRD1Q16881 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
TXNRD1Q16881 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
TXNRD1Q16881 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TXNRD1Q16881 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TXNRD1Q16881 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TXNRD1Q16881 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TXNRD1Q16881 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TXNRD1Q16881 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
TXNRD1Q16881 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
TXNRD1Q16881 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
TXNRD1Q16881 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TXNRD1Q16881 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TXNRD1Q16881 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TXNRD1Q16881 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TXNRD1Q16881 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TXNRD1Q16881 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TXNRD1Q16881 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TXNRD1Q16881 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TXNRD1Q16881 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TXNRD1Q16881 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TXNRD1Q16881 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TXNRD1Q16881 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TXNRD1Q16881 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TXNRD1Q16881 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TXNRD1Q16881 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TXNRD1Q16881 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
TXNRD1Q16881 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TXNRD1Q16881 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
TXNRD1Q16881 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
TXNRD1Q16881 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TXNRD1Q16881 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TXNRD1Q16881 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TXNRD1Q16881 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TXNRD1Q16881 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TXNRD1Q16881 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TXNRD1Q16881 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TXNRD1Q16881 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TXNRD1Q16881 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TXNRD1Q16881 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TXNRD1Q16881 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TXNRD1Q16881 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TXNRD1Q16881 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TXNRD1Q16881 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
TXNRD1Q16881 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TXNRD1Q16881 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TXNRD1Q16881 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TXNRD1Q16881 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TXNRD1Q16881 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TXNRD1Q16881 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TXNRD1Q16881 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TXNRD1Q16881 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TXNRD1Q16881 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TXNRD1Q16881 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
TXNRD1Q16881 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TXNRD1Q16881 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TXNRD1Q16881 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
TXNRD1Q16881 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TXNRD1Q16881 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TXNRD1Q16881 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TXNRD1Q16881 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TXNRD1Q16881 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TXNRD1Q16881 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TXNRD1Q16881 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TXNRD1Q16881 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TXNRD1Q16881 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TXNRD1Q16881 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TXNRD1Q16881 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TXNRD1Q16881 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TXNRD1Q16881 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TXNRD1Q16881 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TXNRD1Q16881 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TXNRD1Q16881 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TXNRD1Q16881 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TXNRD1Q16881 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TXNRD1Q16881 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TXNRD1Q16881 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TXNRD1Q16881 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TXNRD1Q16881 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TXNRD1Q16881 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
TXNRD1Q16881 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TXNRD1Q16881 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TXNRD1Q16881 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TXNRD1Q16881 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TXNRD1Q16881 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TXNRD1Q16881 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
TXNRD1Q16881 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TXNRD1Q16881 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TXNRD1Q16881 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TXNRD1Q16881 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TXNRD1Q16881 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
TXNRD1Q16881 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TXNRD1Q16881 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TXNRD1Q16881 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TXNRD1Q16881 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TXNRD1Q16881 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TXNRD1Q16881 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
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