Protein–RNA interactions for Protein: Q16831

UPP1, Uridine phosphorylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1Q16831 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
UPP1Q16831 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
UPP1Q16831 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
UPP1Q16831 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
UPP1Q16831 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
UPP1Q16831 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
UPP1Q16831 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
UPP1Q16831 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
UPP1Q16831 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
UPP1Q16831 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
UPP1Q16831 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
UPP1Q16831 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
UPP1Q16831 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
UPP1Q16831 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
UPP1Q16831 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
UPP1Q16831 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
UPP1Q16831 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
UPP1Q16831 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
UPP1Q16831 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
UPP1Q16831 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
UPP1Q16831 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
UPP1Q16831 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
UPP1Q16831 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
UPP1Q16831 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
UPP1Q16831 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
UPP1Q16831 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
UPP1Q16831 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
UPP1Q16831 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
UPP1Q16831 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
UPP1Q16831 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
UPP1Q16831 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
UPP1Q16831 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
UPP1Q16831 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
UPP1Q16831 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
UPP1Q16831 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
UPP1Q16831 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
UPP1Q16831 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
UPP1Q16831 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
UPP1Q16831 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
UPP1Q16831 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
UPP1Q16831 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
UPP1Q16831 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
UPP1Q16831 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
UPP1Q16831 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
UPP1Q16831 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
UPP1Q16831 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
UPP1Q16831 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
UPP1Q16831 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
UPP1Q16831 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
UPP1Q16831 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
UPP1Q16831 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
UPP1Q16831 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
UPP1Q16831 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
UPP1Q16831 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
UPP1Q16831 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
UPP1Q16831 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
UPP1Q16831 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
UPP1Q16831 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
UPP1Q16831 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
UPP1Q16831 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
UPP1Q16831 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
UPP1Q16831 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
UPP1Q16831 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
UPP1Q16831 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
UPP1Q16831 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
UPP1Q16831 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
UPP1Q16831 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
UPP1Q16831 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
UPP1Q16831 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
UPP1Q16831 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
UPP1Q16831 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
UPP1Q16831 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
UPP1Q16831 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
UPP1Q16831 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
UPP1Q16831 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
UPP1Q16831 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
UPP1Q16831 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
UPP1Q16831 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
UPP1Q16831 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
UPP1Q16831 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
UPP1Q16831 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
UPP1Q16831 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
UPP1Q16831 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
UPP1Q16831 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
UPP1Q16831 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
UPP1Q16831 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
UPP1Q16831 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
UPP1Q16831 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
UPP1Q16831 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
UPP1Q16831 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
UPP1Q16831 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
UPP1Q16831 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
UPP1Q16831 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
UPP1Q16831 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
UPP1Q16831 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
UPP1Q16831 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
UPP1Q16831 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
UPP1Q16831 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
UPP1Q16831 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
UPP1Q16831 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms