Protein–RNA interactions for Protein: Q16576

RBBP7, Histone-binding protein RBBP7, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP7Q16576 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RBBP7Q16576 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RBBP7Q16576 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RBBP7Q16576 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RBBP7Q16576 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RBBP7Q16576 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RBBP7Q16576 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RBBP7Q16576 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RBBP7Q16576 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RBBP7Q16576 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RBBP7Q16576 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RBBP7Q16576 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RBBP7Q16576 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RBBP7Q16576 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RBBP7Q16576 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RBBP7Q16576 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RBBP7Q16576 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RBBP7Q16576 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RBBP7Q16576 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RBBP7Q16576 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RBBP7Q16576 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RBBP7Q16576 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RBBP7Q16576 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RBBP7Q16576 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RBBP7Q16576 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RBBP7Q16576 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RBBP7Q16576 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RBBP7Q16576 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RBBP7Q16576 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RBBP7Q16576 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RBBP7Q16576 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RBBP7Q16576 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RBBP7Q16576 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RBBP7Q16576 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RBBP7Q16576 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RBBP7Q16576 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RBBP7Q16576 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RBBP7Q16576 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RBBP7Q16576 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RBBP7Q16576 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RBBP7Q16576 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RBBP7Q16576 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RBBP7Q16576 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RBBP7Q16576 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RBBP7Q16576 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RBBP7Q16576 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RBBP7Q16576 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RBBP7Q16576 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RBBP7Q16576 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RBBP7Q16576 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RBBP7Q16576 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RBBP7Q16576 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RBBP7Q16576 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RBBP7Q16576 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RBBP7Q16576 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RBBP7Q16576 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RBBP7Q16576 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RBBP7Q16576 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RBBP7Q16576 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RBBP7Q16576 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RBBP7Q16576 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RBBP7Q16576 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RBBP7Q16576 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RBBP7Q16576 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RBBP7Q16576 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RBBP7Q16576 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RBBP7Q16576 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RBBP7Q16576 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RBBP7Q16576 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RBBP7Q16576 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RBBP7Q16576 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RBBP7Q16576 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RBBP7Q16576 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RBBP7Q16576 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RBBP7Q16576 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RBBP7Q16576 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RBBP7Q16576 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RBBP7Q16576 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RBBP7Q16576 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RBBP7Q16576 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RBBP7Q16576 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RBBP7Q16576 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RBBP7Q16576 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RBBP7Q16576 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RBBP7Q16576 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RBBP7Q16576 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RBBP7Q16576 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RBBP7Q16576 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RBBP7Q16576 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RBBP7Q16576 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RBBP7Q16576 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RBBP7Q16576 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RBBP7Q16576 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RBBP7Q16576 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RBBP7Q16576 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
RBBP7Q16576 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RBBP7Q16576 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RBBP7Q16576 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RBBP7Q16576 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RBBP7Q16576 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms