Protein–RNA interactions for Protein: Q15878

CACNA1E, Voltage-dependent R-type calcium channel subunit alpha-1E, humanhuman

Predictions only

Length 2,313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1EQ15878 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNA1EQ15878 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNA1EQ15878 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNA1EQ15878 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNA1EQ15878 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNA1EQ15878 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNA1EQ15878 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNA1EQ15878 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNA1EQ15878 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNA1EQ15878 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNA1EQ15878 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNA1EQ15878 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNA1EQ15878 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNA1EQ15878 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNA1EQ15878 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNA1EQ15878 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNA1EQ15878 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNA1EQ15878 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNA1EQ15878 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNA1EQ15878 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNA1EQ15878 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNA1EQ15878 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNA1EQ15878 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNA1EQ15878 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNA1EQ15878 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNA1EQ15878 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNA1EQ15878 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNA1EQ15878 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNA1EQ15878 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNA1EQ15878 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNA1EQ15878 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNA1EQ15878 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNA1EQ15878 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNA1EQ15878 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNA1EQ15878 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNA1EQ15878 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNA1EQ15878 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNA1EQ15878 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNA1EQ15878 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNA1EQ15878 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNA1EQ15878 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNA1EQ15878 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNA1EQ15878 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNA1EQ15878 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNA1EQ15878 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNA1EQ15878 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNA1EQ15878 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNA1EQ15878 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNA1EQ15878 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNA1EQ15878 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNA1EQ15878 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNA1EQ15878 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNA1EQ15878 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNA1EQ15878 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNA1EQ15878 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNA1EQ15878 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNA1EQ15878 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNA1EQ15878 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNA1EQ15878 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNA1EQ15878 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNA1EQ15878 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNA1EQ15878 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNA1EQ15878 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNA1EQ15878 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNA1EQ15878 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNA1EQ15878 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNA1EQ15878 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNA1EQ15878 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNA1EQ15878 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNA1EQ15878 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNA1EQ15878 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNA1EQ15878 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNA1EQ15878 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNA1EQ15878 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNA1EQ15878 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNA1EQ15878 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNA1EQ15878 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNA1EQ15878 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNA1EQ15878 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNA1EQ15878 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNA1EQ15878 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNA1EQ15878 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNA1EQ15878 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNA1EQ15878 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNA1EQ15878 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNA1EQ15878 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNA1EQ15878 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNA1EQ15878 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNA1EQ15878 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNA1EQ15878 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNA1EQ15878 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNA1EQ15878 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNA1EQ15878 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNA1EQ15878 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNA1EQ15878 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNA1EQ15878 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNA1EQ15878 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNA1EQ15878 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNA1EQ15878 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNA1EQ15878 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms