Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
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COL19A1Q14993 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
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COL19A1Q14993 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
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COL19A1Q14993 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
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COL19A1Q14993 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
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COL19A1Q14993 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
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COL19A1Q14993 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
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COL19A1Q14993 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
COL19A1Q14993 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
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COL19A1Q14993 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
COL19A1Q14993 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
COL19A1Q14993 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
COL19A1Q14993 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
COL19A1Q14993 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
COL19A1Q14993 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
COL19A1Q14993 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
COL19A1Q14993 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
COL19A1Q14993 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
COL19A1Q14993 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
COL19A1Q14993 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
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COL19A1Q14993 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
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COL19A1Q14993 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
COL19A1Q14993 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
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