Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RFTN1Q14699 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RFTN1Q14699 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RFTN1Q14699 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RFTN1Q14699 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RFTN1Q14699 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RFTN1Q14699 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RFTN1Q14699 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RFTN1Q14699 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RFTN1Q14699 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RFTN1Q14699 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RFTN1Q14699 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RFTN1Q14699 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RFTN1Q14699 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RFTN1Q14699 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RFTN1Q14699 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RFTN1Q14699 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RFTN1Q14699 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RFTN1Q14699 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RFTN1Q14699 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RFTN1Q14699 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RFTN1Q14699 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RFTN1Q14699 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RFTN1Q14699 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RFTN1Q14699 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RFTN1Q14699 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RFTN1Q14699 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RFTN1Q14699 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RFTN1Q14699 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RFTN1Q14699 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RFTN1Q14699 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RFTN1Q14699 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RFTN1Q14699 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RFTN1Q14699 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RFTN1Q14699 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RFTN1Q14699 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RFTN1Q14699 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RFTN1Q14699 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RFTN1Q14699 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
RFTN1Q14699 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RFTN1Q14699 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RFTN1Q14699 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RFTN1Q14699 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RFTN1Q14699 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RFTN1Q14699 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RFTN1Q14699 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RFTN1Q14699 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RFTN1Q14699 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RFTN1Q14699 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RFTN1Q14699 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RFTN1Q14699 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RFTN1Q14699 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RFTN1Q14699 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
RFTN1Q14699 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
RFTN1Q14699 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RFTN1Q14699 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
RFTN1Q14699 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RFTN1Q14699 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RFTN1Q14699 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RFTN1Q14699 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RFTN1Q14699 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RFTN1Q14699 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RFTN1Q14699 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
RFTN1Q14699 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RFTN1Q14699 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RFTN1Q14699 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RFTN1Q14699 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
RFTN1Q14699 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
RFTN1Q14699 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
RFTN1Q14699 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
RFTN1Q14699 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
RFTN1Q14699 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
RFTN1Q14699 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
RFTN1Q14699 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
RFTN1Q14699 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RFTN1Q14699 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RFTN1Q14699 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RFTN1Q14699 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RFTN1Q14699 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RFTN1Q14699 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RFTN1Q14699 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RFTN1Q14699 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RFTN1Q14699 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RFTN1Q14699 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
RFTN1Q14699 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
RFTN1Q14699 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RFTN1Q14699 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RFTN1Q14699 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RFTN1Q14699 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RFTN1Q14699 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
RFTN1Q14699 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RFTN1Q14699 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RFTN1Q14699 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RFTN1Q14699 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RFTN1Q14699 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RFTN1Q14699 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RFTN1Q14699 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RFTN1Q14699 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
RFTN1Q14699 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RFTN1Q14699 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
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