Protein–RNA interactions for Protein: Q14264

ERV3-1, Endogenous retrovirus group 3 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERV3-1Q14264 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERV3-1Q14264 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERV3-1Q14264 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERV3-1Q14264 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERV3-1Q14264 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERV3-1Q14264 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERV3-1Q14264 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERV3-1Q14264 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERV3-1Q14264 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERV3-1Q14264 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERV3-1Q14264 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERV3-1Q14264 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERV3-1Q14264 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERV3-1Q14264 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERV3-1Q14264 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERV3-1Q14264 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERV3-1Q14264 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERV3-1Q14264 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERV3-1Q14264 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERV3-1Q14264 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERV3-1Q14264 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERV3-1Q14264 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERV3-1Q14264 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERV3-1Q14264 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERV3-1Q14264 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERV3-1Q14264 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERV3-1Q14264 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ERV3-1Q14264 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERV3-1Q14264 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERV3-1Q14264 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERV3-1Q14264 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERV3-1Q14264 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERV3-1Q14264 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERV3-1Q14264 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERV3-1Q14264 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERV3-1Q14264 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERV3-1Q14264 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERV3-1Q14264 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERV3-1Q14264 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERV3-1Q14264 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERV3-1Q14264 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERV3-1Q14264 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERV3-1Q14264 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERV3-1Q14264 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERV3-1Q14264 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERV3-1Q14264 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERV3-1Q14264 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ERV3-1Q14264 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERV3-1Q14264 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERV3-1Q14264 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERV3-1Q14264 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERV3-1Q14264 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERV3-1Q14264 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERV3-1Q14264 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ERV3-1Q14264 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERV3-1Q14264 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERV3-1Q14264 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
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ERV3-1Q14264 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERV3-1Q14264 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERV3-1Q14264 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERV3-1Q14264 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERV3-1Q14264 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERV3-1Q14264 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERV3-1Q14264 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERV3-1Q14264 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERV3-1Q14264 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERV3-1Q14264 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
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ERV3-1Q14264 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
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ERV3-1Q14264 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERV3-1Q14264 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERV3-1Q14264 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERV3-1Q14264 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERV3-1Q14264 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERV3-1Q14264 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERV3-1Q14264 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERV3-1Q14264 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERV3-1Q14264 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERV3-1Q14264 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERV3-1Q14264 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERV3-1Q14264 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ERV3-1Q14264 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ERV3-1Q14264 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERV3-1Q14264 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERV3-1Q14264 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERV3-1Q14264 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERV3-1Q14264 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERV3-1Q14264 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERV3-1Q14264 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ERV3-1Q14264 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERV3-1Q14264 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERV3-1Q14264 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERV3-1Q14264 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ERV3-1Q14264 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ERV3-1Q14264 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ERV3-1Q14264 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
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