Protein–RNA interactions for Protein: Q14139

UBE4A, Ubiquitin conjugation factor E4 A, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE4AQ14139 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBE4AQ14139 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBE4AQ14139 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBE4AQ14139 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBE4AQ14139 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
UBE4AQ14139 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBE4AQ14139 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBE4AQ14139 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBE4AQ14139 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBE4AQ14139 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBE4AQ14139 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBE4AQ14139 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBE4AQ14139 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBE4AQ14139 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBE4AQ14139 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBE4AQ14139 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBE4AQ14139 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBE4AQ14139 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBE4AQ14139 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBE4AQ14139 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBE4AQ14139 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBE4AQ14139 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBE4AQ14139 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBE4AQ14139 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBE4AQ14139 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
UBE4AQ14139 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBE4AQ14139 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBE4AQ14139 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBE4AQ14139 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBE4AQ14139 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBE4AQ14139 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBE4AQ14139 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBE4AQ14139 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
UBE4AQ14139 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBE4AQ14139 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBE4AQ14139 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBE4AQ14139 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBE4AQ14139 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
UBE4AQ14139 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBE4AQ14139 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBE4AQ14139 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBE4AQ14139 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
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UBE4AQ14139 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBE4AQ14139 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
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UBE4AQ14139 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBE4AQ14139 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
UBE4AQ14139 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBE4AQ14139 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBE4AQ14139 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
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UBE4AQ14139 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBE4AQ14139 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBE4AQ14139 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBE4AQ14139 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBE4AQ14139 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
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UBE4AQ14139 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBE4AQ14139 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
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UBE4AQ14139 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBE4AQ14139 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
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UBE4AQ14139 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
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UBE4AQ14139 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBE4AQ14139 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBE4AQ14139 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBE4AQ14139 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBE4AQ14139 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBE4AQ14139 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBE4AQ14139 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBE4AQ14139 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBE4AQ14139 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBE4AQ14139 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBE4AQ14139 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBE4AQ14139 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBE4AQ14139 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBE4AQ14139 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBE4AQ14139 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBE4AQ14139 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBE4AQ14139 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBE4AQ14139 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBE4AQ14139 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
UBE4AQ14139 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBE4AQ14139 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBE4AQ14139 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBE4AQ14139 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
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