Protein–RNA interactions for Protein: Q14135

VGLL4, Transcription cofactor vestigial-like protein 4, humanhuman

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Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL4Q14135 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
VGLL4Q14135 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
VGLL4Q14135 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
VGLL4Q14135 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
VGLL4Q14135 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VGLL4Q14135 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
VGLL4Q14135 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
VGLL4Q14135 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VGLL4Q14135 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
VGLL4Q14135 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
VGLL4Q14135 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
VGLL4Q14135 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VGLL4Q14135 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
VGLL4Q14135 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
VGLL4Q14135 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VGLL4Q14135 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VGLL4Q14135 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VGLL4Q14135 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VGLL4Q14135 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VGLL4Q14135 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
VGLL4Q14135 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VGLL4Q14135 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
VGLL4Q14135 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VGLL4Q14135 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
VGLL4Q14135 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
VGLL4Q14135 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
VGLL4Q14135 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VGLL4Q14135 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
VGLL4Q14135 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
VGLL4Q14135 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
VGLL4Q14135 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
VGLL4Q14135 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VGLL4Q14135 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
VGLL4Q14135 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
VGLL4Q14135 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VGLL4Q14135 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VGLL4Q14135 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
VGLL4Q14135 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
VGLL4Q14135 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
VGLL4Q14135 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
VGLL4Q14135 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
VGLL4Q14135 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
VGLL4Q14135 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
VGLL4Q14135 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
VGLL4Q14135 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
VGLL4Q14135 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
VGLL4Q14135 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
VGLL4Q14135 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
VGLL4Q14135 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
VGLL4Q14135 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
VGLL4Q14135 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
VGLL4Q14135 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
VGLL4Q14135 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
VGLL4Q14135 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
VGLL4Q14135 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
VGLL4Q14135 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
VGLL4Q14135 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VGLL4Q14135 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
VGLL4Q14135 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
VGLL4Q14135 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VGLL4Q14135 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VGLL4Q14135 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VGLL4Q14135 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
VGLL4Q14135 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
VGLL4Q14135 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
VGLL4Q14135 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
VGLL4Q14135 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
VGLL4Q14135 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VGLL4Q14135 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
VGLL4Q14135 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VGLL4Q14135 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
VGLL4Q14135 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VGLL4Q14135 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VGLL4Q14135 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
VGLL4Q14135 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VGLL4Q14135 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VGLL4Q14135 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VGLL4Q14135 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
VGLL4Q14135 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VGLL4Q14135 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VGLL4Q14135 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
VGLL4Q14135 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VGLL4Q14135 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VGLL4Q14135 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VGLL4Q14135 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
VGLL4Q14135 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
VGLL4Q14135 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VGLL4Q14135 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VGLL4Q14135 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
VGLL4Q14135 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
VGLL4Q14135 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
VGLL4Q14135 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
VGLL4Q14135 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
VGLL4Q14135 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
VGLL4Q14135 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
VGLL4Q14135 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VGLL4Q14135 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
VGLL4Q14135 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
VGLL4Q14135 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
VGLL4Q14135 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
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