Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SKP2Q13309 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SKP2Q13309 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SKP2Q13309 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SKP2Q13309 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SKP2Q13309 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SKP2Q13309 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SKP2Q13309 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SKP2Q13309 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SKP2Q13309 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SKP2Q13309 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SKP2Q13309 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SKP2Q13309 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SKP2Q13309 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SKP2Q13309 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SKP2Q13309 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SKP2Q13309 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SKP2Q13309 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SKP2Q13309 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SKP2Q13309 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SKP2Q13309 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SKP2Q13309 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SKP2Q13309 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SKP2Q13309 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SKP2Q13309 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SKP2Q13309 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SKP2Q13309 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SKP2Q13309 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SKP2Q13309 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SKP2Q13309 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SKP2Q13309 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SKP2Q13309 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SKP2Q13309 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SKP2Q13309 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SKP2Q13309 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SKP2Q13309 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SKP2Q13309 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SKP2Q13309 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SKP2Q13309 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SKP2Q13309 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SKP2Q13309 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SKP2Q13309 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SKP2Q13309 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SKP2Q13309 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SKP2Q13309 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SKP2Q13309 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SKP2Q13309 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SKP2Q13309 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SKP2Q13309 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SKP2Q13309 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SKP2Q13309 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SKP2Q13309 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SKP2Q13309 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SKP2Q13309 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SKP2Q13309 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SKP2Q13309 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SKP2Q13309 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SKP2Q13309 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SKP2Q13309 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SKP2Q13309 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SKP2Q13309 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SKP2Q13309 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SKP2Q13309 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SKP2Q13309 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SKP2Q13309 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SKP2Q13309 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SKP2Q13309 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SKP2Q13309 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SKP2Q13309 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SKP2Q13309 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SKP2Q13309 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SKP2Q13309 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SKP2Q13309 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SKP2Q13309 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SKP2Q13309 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SKP2Q13309 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SKP2Q13309 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SKP2Q13309 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SKP2Q13309 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SKP2Q13309 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SKP2Q13309 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SKP2Q13309 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SKP2Q13309 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SKP2Q13309 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SKP2Q13309 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SKP2Q13309 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SKP2Q13309 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SKP2Q13309 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SKP2Q13309 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SKP2Q13309 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SKP2Q13309 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SKP2Q13309 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SKP2Q13309 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SKP2Q13309 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SKP2Q13309 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SKP2Q13309 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SKP2Q13309 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SKP2Q13309 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SKP2Q13309 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SKP2Q13309 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
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