Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CLN3Q13286 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CLN3Q13286 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CLN3Q13286 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CLN3Q13286 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CLN3Q13286 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CLN3Q13286 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CLN3Q13286 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CLN3Q13286 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CLN3Q13286 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CLN3Q13286 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CLN3Q13286 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CLN3Q13286 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CLN3Q13286 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CLN3Q13286 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CLN3Q13286 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CLN3Q13286 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CLN3Q13286 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CLN3Q13286 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CLN3Q13286 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CLN3Q13286 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CLN3Q13286 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CLN3Q13286 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CLN3Q13286 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CLN3Q13286 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CLN3Q13286 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CLN3Q13286 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CLN3Q13286 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CLN3Q13286 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CLN3Q13286 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CLN3Q13286 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CLN3Q13286 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CLN3Q13286 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CLN3Q13286 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CLN3Q13286 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CLN3Q13286 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CLN3Q13286 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CLN3Q13286 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CLN3Q13286 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CLN3Q13286 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CLN3Q13286 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLN3Q13286 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLN3Q13286 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CLN3Q13286 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLN3Q13286 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLN3Q13286 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLN3Q13286 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLN3Q13286 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLN3Q13286 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLN3Q13286 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLN3Q13286 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLN3Q13286 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CLN3Q13286 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CLN3Q13286 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLN3Q13286 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLN3Q13286 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CLN3Q13286 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLN3Q13286 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CLN3Q13286 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLN3Q13286 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLN3Q13286 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLN3Q13286 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLN3Q13286 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLN3Q13286 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLN3Q13286 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLN3Q13286 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLN3Q13286 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLN3Q13286 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CLN3Q13286 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLN3Q13286 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLN3Q13286 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLN3Q13286 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLN3Q13286 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLN3Q13286 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLN3Q13286 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLN3Q13286 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLN3Q13286 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLN3Q13286 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLN3Q13286 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLN3Q13286 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLN3Q13286 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLN3Q13286 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLN3Q13286 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLN3Q13286 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CLN3Q13286 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CLN3Q13286 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CLN3Q13286 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLN3Q13286 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLN3Q13286 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLN3Q13286 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLN3Q13286 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLN3Q13286 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLN3Q13286 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLN3Q13286 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLN3Q13286 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLN3Q13286 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLN3Q13286 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLN3Q13286 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLN3Q13286 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CLN3Q13286 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
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