Protein–RNA interactions for Protein: Q13275

SEMA3F, Semaphorin-3F, humanhuman

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Length 785 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3FQ13275 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SEMA3FQ13275 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SEMA3FQ13275 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SEMA3FQ13275 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SEMA3FQ13275 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SEMA3FQ13275 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SEMA3FQ13275 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SEMA3FQ13275 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SEMA3FQ13275 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SEMA3FQ13275 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SEMA3FQ13275 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SEMA3FQ13275 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SEMA3FQ13275 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SEMA3FQ13275 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SEMA3FQ13275 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SEMA3FQ13275 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SEMA3FQ13275 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SEMA3FQ13275 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SEMA3FQ13275 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SEMA3FQ13275 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SEMA3FQ13275 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SEMA3FQ13275 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SEMA3FQ13275 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SEMA3FQ13275 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SEMA3FQ13275 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SEMA3FQ13275 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SEMA3FQ13275 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SEMA3FQ13275 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SEMA3FQ13275 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SEMA3FQ13275 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SEMA3FQ13275 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SEMA3FQ13275 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
SEMA3FQ13275 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SEMA3FQ13275 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SEMA3FQ13275 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SEMA3FQ13275 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SEMA3FQ13275 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SEMA3FQ13275 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SEMA3FQ13275 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SEMA3FQ13275 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SEMA3FQ13275 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SEMA3FQ13275 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SEMA3FQ13275 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SEMA3FQ13275 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SEMA3FQ13275 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SEMA3FQ13275 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SEMA3FQ13275 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SEMA3FQ13275 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SEMA3FQ13275 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SEMA3FQ13275 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SEMA3FQ13275 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SEMA3FQ13275 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SEMA3FQ13275 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SEMA3FQ13275 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SEMA3FQ13275 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SEMA3FQ13275 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SEMA3FQ13275 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SEMA3FQ13275 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SEMA3FQ13275 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SEMA3FQ13275 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SEMA3FQ13275 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SEMA3FQ13275 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SEMA3FQ13275 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SEMA3FQ13275 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SEMA3FQ13275 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SEMA3FQ13275 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SEMA3FQ13275 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SEMA3FQ13275 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SEMA3FQ13275 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SEMA3FQ13275 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SEMA3FQ13275 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SEMA3FQ13275 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SEMA3FQ13275 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEMA3FQ13275 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEMA3FQ13275 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEMA3FQ13275 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEMA3FQ13275 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEMA3FQ13275 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEMA3FQ13275 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEMA3FQ13275 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEMA3FQ13275 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEMA3FQ13275 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEMA3FQ13275 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEMA3FQ13275 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SEMA3FQ13275 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEMA3FQ13275 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEMA3FQ13275 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEMA3FQ13275 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEMA3FQ13275 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SEMA3FQ13275 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEMA3FQ13275 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEMA3FQ13275 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEMA3FQ13275 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEMA3FQ13275 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEMA3FQ13275 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEMA3FQ13275 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEMA3FQ13275 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEMA3FQ13275 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEMA3FQ13275 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEMA3FQ13275 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
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