Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SRSF5Q13243 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SRSF5Q13243 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SRSF5Q13243 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SRSF5Q13243 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SRSF5Q13243 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SRSF5Q13243 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SRSF5Q13243 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SRSF5Q13243 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SRSF5Q13243 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SRSF5Q13243 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SRSF5Q13243 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SRSF5Q13243 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SRSF5Q13243 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SRSF5Q13243 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SRSF5Q13243 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SRSF5Q13243 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SRSF5Q13243 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SRSF5Q13243 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SRSF5Q13243 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SRSF5Q13243 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SRSF5Q13243 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SRSF5Q13243 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SRSF5Q13243 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SRSF5Q13243 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SRSF5Q13243 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SRSF5Q13243 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SRSF5Q13243 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SRSF5Q13243 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SRSF5Q13243 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SRSF5Q13243 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SRSF5Q13243 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SRSF5Q13243 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SRSF5Q13243 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SRSF5Q13243 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SRSF5Q13243 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SRSF5Q13243 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SRSF5Q13243 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SRSF5Q13243 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SRSF5Q13243 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SRSF5Q13243 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SRSF5Q13243 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SRSF5Q13243 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SRSF5Q13243 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SRSF5Q13243 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SRSF5Q13243 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SRSF5Q13243 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SRSF5Q13243 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SRSF5Q13243 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SRSF5Q13243 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SRSF5Q13243 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SRSF5Q13243 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SRSF5Q13243 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SRSF5Q13243 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SRSF5Q13243 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SRSF5Q13243 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SRSF5Q13243 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SRSF5Q13243 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SRSF5Q13243 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SRSF5Q13243 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SRSF5Q13243 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SRSF5Q13243 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SRSF5Q13243 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SRSF5Q13243 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SRSF5Q13243 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SRSF5Q13243 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SRSF5Q13243 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SRSF5Q13243 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SRSF5Q13243 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SRSF5Q13243 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SRSF5Q13243 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SRSF5Q13243 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SRSF5Q13243 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SRSF5Q13243 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SRSF5Q13243 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SRSF5Q13243 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SRSF5Q13243 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SRSF5Q13243 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SRSF5Q13243 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SRSF5Q13243 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SRSF5Q13243 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SRSF5Q13243 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SRSF5Q13243 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SRSF5Q13243 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SRSF5Q13243 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SRSF5Q13243 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SRSF5Q13243 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SRSF5Q13243 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SRSF5Q13243 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SRSF5Q13243 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SRSF5Q13243 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SRSF5Q13243 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SRSF5Q13243 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SRSF5Q13243 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SRSF5Q13243 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SRSF5Q13243 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SRSF5Q13243 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SRSF5Q13243 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SRSF5Q13243 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SRSF5Q13243 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
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