Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
NFX1Q12986 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NFX1Q12986 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NFX1Q12986 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NFX1Q12986 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NFX1Q12986 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NFX1Q12986 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NFX1Q12986 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NFX1Q12986 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NFX1Q12986 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NFX1Q12986 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
NFX1Q12986 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NFX1Q12986 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
NFX1Q12986 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NFX1Q12986 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
NFX1Q12986 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NFX1Q12986 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NFX1Q12986 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NFX1Q12986 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NFX1Q12986 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NFX1Q12986 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NFX1Q12986 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NFX1Q12986 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NFX1Q12986 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NFX1Q12986 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NFX1Q12986 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NFX1Q12986 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NFX1Q12986 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NFX1Q12986 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NFX1Q12986 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NFX1Q12986 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NFX1Q12986 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NFX1Q12986 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NFX1Q12986 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NFX1Q12986 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NFX1Q12986 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NFX1Q12986 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NFX1Q12986 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NFX1Q12986 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NFX1Q12986 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NFX1Q12986 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NFX1Q12986 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NFX1Q12986 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NFX1Q12986 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NFX1Q12986 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NFX1Q12986 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NFX1Q12986 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NFX1Q12986 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NFX1Q12986 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NFX1Q12986 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NFX1Q12986 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NFX1Q12986 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NFX1Q12986 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NFX1Q12986 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
NFX1Q12986 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NFX1Q12986 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NFX1Q12986 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NFX1Q12986 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NFX1Q12986 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NFX1Q12986 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NFX1Q12986 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NFX1Q12986 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
NFX1Q12986 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NFX1Q12986 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NFX1Q12986 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NFX1Q12986 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NFX1Q12986 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NFX1Q12986 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NFX1Q12986 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NFX1Q12986 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NFX1Q12986 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NFX1Q12986 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NFX1Q12986 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NFX1Q12986 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NFX1Q12986 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
NFX1Q12986 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NFX1Q12986 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NFX1Q12986 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NFX1Q12986 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NFX1Q12986 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
NFX1Q12986 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
NFX1Q12986 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
NFX1Q12986 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NFX1Q12986 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NFX1Q12986 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NFX1Q12986 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
NFX1Q12986 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NFX1Q12986 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NFX1Q12986 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NFX1Q12986 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NFX1Q12986 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NFX1Q12986 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NFX1Q12986 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NFX1Q12986 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
NFX1Q12986 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NFX1Q12986 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NFX1Q12986 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NFX1Q12986 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NFX1Q12986 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
NFX1Q12986 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
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