Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CNTN1Q12860 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CNTN1Q12860 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CNTN1Q12860 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CNTN1Q12860 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CNTN1Q12860 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CNTN1Q12860 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CNTN1Q12860 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CNTN1Q12860 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CNTN1Q12860 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CNTN1Q12860 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CNTN1Q12860 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
CNTN1Q12860 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CNTN1Q12860 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CNTN1Q12860 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CNTN1Q12860 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CNTN1Q12860 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CNTN1Q12860 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
CNTN1Q12860 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CNTN1Q12860 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CNTN1Q12860 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CNTN1Q12860 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CNTN1Q12860 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CNTN1Q12860 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CNTN1Q12860 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CNTN1Q12860 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CNTN1Q12860 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CNTN1Q12860 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CNTN1Q12860 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CNTN1Q12860 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CNTN1Q12860 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CNTN1Q12860 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CNTN1Q12860 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
CNTN1Q12860 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CNTN1Q12860 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CNTN1Q12860 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CNTN1Q12860 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CNTN1Q12860 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CNTN1Q12860 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CNTN1Q12860 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CNTN1Q12860 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CNTN1Q12860 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CNTN1Q12860 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CNTN1Q12860 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CNTN1Q12860 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CNTN1Q12860 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CNTN1Q12860 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CNTN1Q12860 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
CNTN1Q12860 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CNTN1Q12860 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CNTN1Q12860 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CNTN1Q12860 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CNTN1Q12860 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CNTN1Q12860 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CNTN1Q12860 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CNTN1Q12860 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CNTN1Q12860 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CNTN1Q12860 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CNTN1Q12860 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CNTN1Q12860 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CNTN1Q12860 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CNTN1Q12860 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
CNTN1Q12860 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CNTN1Q12860 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
CNTN1Q12860 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
CNTN1Q12860 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CNTN1Q12860 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
CNTN1Q12860 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
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CNTN1Q12860 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CNTN1Q12860 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CNTN1Q12860 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CNTN1Q12860 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CNTN1Q12860 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CNTN1Q12860 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CNTN1Q12860 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CNTN1Q12860 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CNTN1Q12860 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CNTN1Q12860 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CNTN1Q12860 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CNTN1Q12860 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CNTN1Q12860 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CNTN1Q12860 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CNTN1Q12860 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CNTN1Q12860 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CNTN1Q12860 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CNTN1Q12860 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CNTN1Q12860 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CNTN1Q12860 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CNTN1Q12860 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CNTN1Q12860 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
CNTN1Q12860 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
CNTN1Q12860 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CNTN1Q12860 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CNTN1Q12860 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
CNTN1Q12860 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CNTN1Q12860 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CNTN1Q12860 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CNTN1Q12860 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CNTN1Q12860 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
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