Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF3C1Q12789 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF3C1Q12789 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF3C1Q12789 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF3C1Q12789 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF3C1Q12789 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF3C1Q12789 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF3C1Q12789 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF3C1Q12789 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF3C1Q12789 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF3C1Q12789 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GTF3C1Q12789 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GTF3C1Q12789 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GTF3C1Q12789 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GTF3C1Q12789 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GTF3C1Q12789 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GTF3C1Q12789 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GTF3C1Q12789 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GTF3C1Q12789 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GTF3C1Q12789 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GTF3C1Q12789 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GTF3C1Q12789 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GTF3C1Q12789 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GTF3C1Q12789 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GTF3C1Q12789 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GTF3C1Q12789 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GTF3C1Q12789 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GTF3C1Q12789 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GTF3C1Q12789 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GTF3C1Q12789 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GTF3C1Q12789 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GTF3C1Q12789 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GTF3C1Q12789 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GTF3C1Q12789 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GTF3C1Q12789 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GTF3C1Q12789 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GTF3C1Q12789 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GTF3C1Q12789 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GTF3C1Q12789 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GTF3C1Q12789 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GTF3C1Q12789 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GTF3C1Q12789 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GTF3C1Q12789 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GTF3C1Q12789 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GTF3C1Q12789 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GTF3C1Q12789 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GTF3C1Q12789 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GTF3C1Q12789 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GTF3C1Q12789 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GTF3C1Q12789 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GTF3C1Q12789 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GTF3C1Q12789 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
GTF3C1Q12789 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
GTF3C1Q12789 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
GTF3C1Q12789 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GTF3C1Q12789 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GTF3C1Q12789 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GTF3C1Q12789 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GTF3C1Q12789 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
GTF3C1Q12789 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GTF3C1Q12789 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
GTF3C1Q12789 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GTF3C1Q12789 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GTF3C1Q12789 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GTF3C1Q12789 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GTF3C1Q12789 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GTF3C1Q12789 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GTF3C1Q12789 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GTF3C1Q12789 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GTF3C1Q12789 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GTF3C1Q12789 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GTF3C1Q12789 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GTF3C1Q12789 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GTF3C1Q12789 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GTF3C1Q12789 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GTF3C1Q12789 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GTF3C1Q12789 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GTF3C1Q12789 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GTF3C1Q12789 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GTF3C1Q12789 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GTF3C1Q12789 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GTF3C1Q12789 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GTF3C1Q12789 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GTF3C1Q12789 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GTF3C1Q12789 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GTF3C1Q12789 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GTF3C1Q12789 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GTF3C1Q12789 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GTF3C1Q12789 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GTF3C1Q12789 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GTF3C1Q12789 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GTF3C1Q12789 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GTF3C1Q12789 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GTF3C1Q12789 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GTF3C1Q12789 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GTF3C1Q12789 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GTF3C1Q12789 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GTF3C1Q12789 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
GTF3C1Q12789 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
GTF3C1Q12789 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms