Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 HMGN1P6-201ENST00000438508 291 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CACNB1Q02641 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CACNB1Q02641 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CACNB1Q02641 LINC00977-201ENST00000509893 1163 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CACNB1Q02641 AC124069.1-201ENST00000517454 735 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CACNB1Q02641 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CACNB1Q02641 AC016737.1-201ENST00000605739 1068 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CACNB1Q02641 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CACNB1Q02641 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CACNB1Q02641 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
CACNB1Q02641 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CACNB1Q02641 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CACNB1Q02641 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CACNB1Q02641 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CACNB1Q02641 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CACNB1Q02641 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CACNB1Q02641 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CACNB1Q02641 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CACNB1Q02641 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CACNB1Q02641 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CACNB1Q02641 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CACNB1Q02641 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CACNB1Q02641 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CACNB1Q02641 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CACNB1Q02641 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
CACNB1Q02641 RPS20P25-201ENST00000412447 352 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CACNB1Q02641 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CACNB1Q02641 AC093752.2-201ENST00000506942 573 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CACNB1Q02641 ELOC-204ENST00000519487 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CACNB1Q02641 SRPK2P-201ENST00000523408 1100 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CACNB1Q02641 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CACNB1Q02641 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CACNB1Q02641 AC091057.2-201ENST00000602594 792 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CACNB1Q02641 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CACNB1Q02641 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CACNB1Q02641 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CACNB1Q02641 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CACNB1Q02641 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CACNB1Q02641 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CACNB1Q02641 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CACNB1Q02641 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CACNB1Q02641 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CACNB1Q02641 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CACNB1Q02641 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CACNB1Q02641 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CACNB1Q02641 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CACNB1Q02641 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CACNB1Q02641 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CACNB1Q02641 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CACNB1Q02641 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CACNB1Q02641 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CACNB1Q02641 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CACNB1Q02641 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CACNB1Q02641 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CACNB1Q02641 PRKAA1-201ENST00000296800 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CACNB1Q02641 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CACNB1Q02641 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CACNB1Q02641 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CACNB1Q02641 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CACNB1Q02641 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CACNB1Q02641 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CACNB1Q02641 CAB39P1-201ENST00000502277 460 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CACNB1Q02641 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CACNB1Q02641 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CACNB1Q02641 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CACNB1Q02641 AC090772.3-201ENST00000583267 735 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CACNB1Q02641 AC016727.1-205ENST00000605437 569 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CACNB1Q02641 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CACNB1Q02641 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CACNB1Q02641 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CACNB1Q02641 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CACNB1Q02641 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CACNB1Q02641 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CACNB1Q02641 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CACNB1Q02641 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CACNB1Q02641 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CACNB1Q02641 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CACNB1Q02641 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CACNB1Q02641 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CACNB1Q02641 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CACNB1Q02641 MAPK10-379ENST00000642013 1385 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CACNB1Q02641 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CACNB1Q02641 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CACNB1Q02641 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CACNB1Q02641 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CACNB1Q02641 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CACNB1Q02641 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CACNB1Q02641 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CACNB1Q02641 HGF-202ENST00000354224 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CACNB1Q02641 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CACNB1Q02641 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CACNB1Q02641 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CACNB1Q02641 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CACNB1Q02641 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CACNB1Q02641 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CACNB1Q02641 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CACNB1Q02641 AP003041.2-201ENST00000525666 1180 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CACNB1Q02641 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CACNB1Q02641 AC025040.1-201ENST00000560375 1284 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CACNB1Q02641 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms