Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BNC1Q01954 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BNC1Q01954 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BNC1Q01954 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BNC1Q01954 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BNC1Q01954 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BNC1Q01954 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BNC1Q01954 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BNC1Q01954 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BNC1Q01954 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BNC1Q01954 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BNC1Q01954 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BNC1Q01954 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BNC1Q01954 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BNC1Q01954 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BNC1Q01954 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BNC1Q01954 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BNC1Q01954 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BNC1Q01954 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BNC1Q01954 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BNC1Q01954 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BNC1Q01954 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BNC1Q01954 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BNC1Q01954 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BNC1Q01954 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BNC1Q01954 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BNC1Q01954 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BNC1Q01954 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BNC1Q01954 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BNC1Q01954 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BNC1Q01954 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BNC1Q01954 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BNC1Q01954 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BNC1Q01954 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BNC1Q01954 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BNC1Q01954 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BNC1Q01954 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BNC1Q01954 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BNC1Q01954 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BNC1Q01954 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BNC1Q01954 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BNC1Q01954 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BNC1Q01954 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BNC1Q01954 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BNC1Q01954 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
BNC1Q01954 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
BNC1Q01954 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BNC1Q01954 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BNC1Q01954 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BNC1Q01954 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BNC1Q01954 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BNC1Q01954 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BNC1Q01954 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BNC1Q01954 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BNC1Q01954 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BNC1Q01954 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BNC1Q01954 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BNC1Q01954 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BNC1Q01954 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BNC1Q01954 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BNC1Q01954 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BNC1Q01954 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BNC1Q01954 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BNC1Q01954 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BNC1Q01954 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BNC1Q01954 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
BNC1Q01954 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BNC1Q01954 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BNC1Q01954 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BNC1Q01954 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
BNC1Q01954 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BNC1Q01954 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BNC1Q01954 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
BNC1Q01954 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BNC1Q01954 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BNC1Q01954 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BNC1Q01954 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BNC1Q01954 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BNC1Q01954 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BNC1Q01954 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BNC1Q01954 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BNC1Q01954 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BNC1Q01954 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BNC1Q01954 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BNC1Q01954 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BNC1Q01954 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BNC1Q01954 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BNC1Q01954 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BNC1Q01954 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BNC1Q01954 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
BNC1Q01954 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BNC1Q01954 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BNC1Q01954 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BNC1Q01954 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BNC1Q01954 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BNC1Q01954 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BNC1Q01954 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BNC1Q01954 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BNC1Q01954 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BNC1Q01954 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms