Protein–RNA interactions for Protein: Q00536

CDK16, Cyclin-dependent kinase 16, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK16Q00536 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDK16Q00536 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDK16Q00536 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDK16Q00536 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CDK16Q00536 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDK16Q00536 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDK16Q00536 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDK16Q00536 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDK16Q00536 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CDK16Q00536 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDK16Q00536 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDK16Q00536 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDK16Q00536 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDK16Q00536 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDK16Q00536 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDK16Q00536 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDK16Q00536 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDK16Q00536 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDK16Q00536 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDK16Q00536 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDK16Q00536 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDK16Q00536 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDK16Q00536 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDK16Q00536 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDK16Q00536 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDK16Q00536 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDK16Q00536 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDK16Q00536 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDK16Q00536 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDK16Q00536 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDK16Q00536 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDK16Q00536 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDK16Q00536 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDK16Q00536 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDK16Q00536 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDK16Q00536 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDK16Q00536 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDK16Q00536 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDK16Q00536 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDK16Q00536 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDK16Q00536 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDK16Q00536 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDK16Q00536 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDK16Q00536 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDK16Q00536 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDK16Q00536 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDK16Q00536 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDK16Q00536 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDK16Q00536 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDK16Q00536 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDK16Q00536 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDK16Q00536 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CDK16Q00536 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDK16Q00536 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDK16Q00536 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CDK16Q00536 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CDK16Q00536 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDK16Q00536 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDK16Q00536 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDK16Q00536 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDK16Q00536 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDK16Q00536 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CDK16Q00536 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDK16Q00536 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDK16Q00536 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDK16Q00536 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDK16Q00536 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDK16Q00536 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDK16Q00536 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDK16Q00536 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDK16Q00536 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDK16Q00536 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDK16Q00536 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDK16Q00536 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CDK16Q00536 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDK16Q00536 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDK16Q00536 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDK16Q00536 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDK16Q00536 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDK16Q00536 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDK16Q00536 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDK16Q00536 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDK16Q00536 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CDK16Q00536 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDK16Q00536 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDK16Q00536 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDK16Q00536 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDK16Q00536 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDK16Q00536 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDK16Q00536 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CDK16Q00536 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDK16Q00536 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDK16Q00536 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDK16Q00536 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDK16Q00536 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDK16Q00536 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDK16Q00536 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CDK16Q00536 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDK16Q00536 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDK16Q00536 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms