Protein–RNA interactions for Protein: Q00526

CDK3, Cyclin-dependent kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK3Q00526 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK3Q00526 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK3Q00526 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK3Q00526 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK3Q00526 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK3Q00526 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK3Q00526 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK3Q00526 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK3Q00526 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK3Q00526 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK3Q00526 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK3Q00526 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK3Q00526 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK3Q00526 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK3Q00526 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK3Q00526 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK3Q00526 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK3Q00526 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK3Q00526 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK3Q00526 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK3Q00526 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK3Q00526 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK3Q00526 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK3Q00526 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK3Q00526 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK3Q00526 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK3Q00526 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK3Q00526 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK3Q00526 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK3Q00526 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK3Q00526 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK3Q00526 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK3Q00526 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK3Q00526 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK3Q00526 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK3Q00526 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK3Q00526 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK3Q00526 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK3Q00526 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK3Q00526 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK3Q00526 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK3Q00526 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK3Q00526 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK3Q00526 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK3Q00526 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDK3Q00526 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDK3Q00526 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDK3Q00526 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDK3Q00526 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDK3Q00526 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDK3Q00526 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDK3Q00526 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDK3Q00526 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDK3Q00526 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDK3Q00526 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDK3Q00526 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CDK3Q00526 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CDK3Q00526 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDK3Q00526 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDK3Q00526 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDK3Q00526 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDK3Q00526 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDK3Q00526 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDK3Q00526 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDK3Q00526 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDK3Q00526 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDK3Q00526 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDK3Q00526 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDK3Q00526 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDK3Q00526 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CDK3Q00526 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CDK3Q00526 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDK3Q00526 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDK3Q00526 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDK3Q00526 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDK3Q00526 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDK3Q00526 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDK3Q00526 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDK3Q00526 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDK3Q00526 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDK3Q00526 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDK3Q00526 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDK3Q00526 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDK3Q00526 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDK3Q00526 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CDK3Q00526 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDK3Q00526 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDK3Q00526 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDK3Q00526 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDK3Q00526 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDK3Q00526 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDK3Q00526 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CDK3Q00526 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDK3Q00526 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDK3Q00526 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDK3Q00526 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDK3Q00526 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDK3Q00526 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDK3Q00526 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDK3Q00526 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms