Protein–RNA interactions for Protein: P81133

SIM1, Single-minded homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIM1P81133 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SIM1P81133 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SIM1P81133 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SIM1P81133 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SIM1P81133 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SIM1P81133 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SIM1P81133 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SIM1P81133 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SIM1P81133 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SIM1P81133 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SIM1P81133 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SIM1P81133 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SIM1P81133 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SIM1P81133 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SIM1P81133 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SIM1P81133 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SIM1P81133 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SIM1P81133 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SIM1P81133 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SIM1P81133 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SIM1P81133 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SIM1P81133 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SIM1P81133 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SIM1P81133 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SIM1P81133 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SIM1P81133 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SIM1P81133 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SIM1P81133 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SIM1P81133 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SIM1P81133 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SIM1P81133 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SIM1P81133 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SIM1P81133 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SIM1P81133 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SIM1P81133 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SIM1P81133 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SIM1P81133 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SIM1P81133 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SIM1P81133 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SIM1P81133 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SIM1P81133 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SIM1P81133 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SIM1P81133 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SIM1P81133 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SIM1P81133 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SIM1P81133 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SIM1P81133 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SIM1P81133 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SIM1P81133 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SIM1P81133 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SIM1P81133 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SIM1P81133 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SIM1P81133 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SIM1P81133 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SIM1P81133 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SIM1P81133 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SIM1P81133 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SIM1P81133 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SIM1P81133 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SIM1P81133 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SIM1P81133 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SIM1P81133 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SIM1P81133 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SIM1P81133 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SIM1P81133 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SIM1P81133 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SIM1P81133 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SIM1P81133 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SIM1P81133 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SIM1P81133 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SIM1P81133 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SIM1P81133 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SIM1P81133 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SIM1P81133 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SIM1P81133 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SIM1P81133 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SIM1P81133 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SIM1P81133 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SIM1P81133 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SIM1P81133 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SIM1P81133 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SIM1P81133 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SIM1P81133 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SIM1P81133 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SIM1P81133 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SIM1P81133 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SIM1P81133 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SIM1P81133 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SIM1P81133 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SIM1P81133 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SIM1P81133 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SIM1P81133 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SIM1P81133 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SIM1P81133 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SIM1P81133 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SIM1P81133 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SIM1P81133 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SIM1P81133 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SIM1P81133 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SIM1P81133 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms