Protein–RNA interactions for Protein: P58499

FAM3B, Protein FAM3B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3BP58499 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FAM3BP58499 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FAM3BP58499 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
FAM3BP58499 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
FAM3BP58499 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
FAM3BP58499 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
FAM3BP58499 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
FAM3BP58499 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
FAM3BP58499 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
FAM3BP58499 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms