Protein–RNA interactions for Protein: P57735

RAB25, Ras-related protein Rab-25, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB25P57735 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB25P57735 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB25P57735 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB25P57735 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB25P57735 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB25P57735 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB25P57735 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB25P57735 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB25P57735 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB25P57735 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB25P57735 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB25P57735 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB25P57735 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB25P57735 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB25P57735 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB25P57735 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB25P57735 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB25P57735 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB25P57735 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB25P57735 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB25P57735 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB25P57735 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB25P57735 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB25P57735 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB25P57735 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB25P57735 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB25P57735 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB25P57735 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB25P57735 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB25P57735 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB25P57735 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB25P57735 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB25P57735 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB25P57735 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB25P57735 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB25P57735 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB25P57735 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB25P57735 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB25P57735 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB25P57735 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB25P57735 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB25P57735 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB25P57735 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB25P57735 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB25P57735 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB25P57735 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB25P57735 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB25P57735 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB25P57735 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB25P57735 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB25P57735 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB25P57735 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB25P57735 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB25P57735 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB25P57735 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB25P57735 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB25P57735 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB25P57735 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB25P57735 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB25P57735 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB25P57735 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB25P57735 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB25P57735 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB25P57735 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB25P57735 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB25P57735 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB25P57735 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB25P57735 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB25P57735 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB25P57735 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB25P57735 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB25P57735 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB25P57735 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB25P57735 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB25P57735 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB25P57735 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB25P57735 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB25P57735 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB25P57735 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB25P57735 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB25P57735 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB25P57735 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB25P57735 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB25P57735 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB25P57735 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB25P57735 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB25P57735 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB25P57735 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB25P57735 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB25P57735 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB25P57735 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB25P57735 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB25P57735 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB25P57735 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB25P57735 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB25P57735 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB25P57735 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB25P57735 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB25P57735 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB25P57735 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms