Protein–RNA interactions for Protein: P57053

H2BFS, Histone H2B type F-S, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2BFSP57053 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
H2BFSP57053 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2BFSP57053 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2BFSP57053 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2BFSP57053 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2BFSP57053 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2BFSP57053 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
H2BFSP57053 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2BFSP57053 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2BFSP57053 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2BFSP57053 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2BFSP57053 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2BFSP57053 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2BFSP57053 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2BFSP57053 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2BFSP57053 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2BFSP57053 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
H2BFSP57053 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2BFSP57053 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2BFSP57053 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
H2BFSP57053 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2BFSP57053 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2BFSP57053 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2BFSP57053 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2BFSP57053 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2BFSP57053 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2BFSP57053 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2BFSP57053 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2BFSP57053 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2BFSP57053 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
H2BFSP57053 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2BFSP57053 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2BFSP57053 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2BFSP57053 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2BFSP57053 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2BFSP57053 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2BFSP57053 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2BFSP57053 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2BFSP57053 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2BFSP57053 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2BFSP57053 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2BFSP57053 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
H2BFSP57053 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2BFSP57053 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2BFSP57053 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2BFSP57053 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2BFSP57053 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2BFSP57053 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2BFSP57053 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2BFSP57053 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2BFSP57053 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2BFSP57053 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2BFSP57053 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
H2BFSP57053 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
H2BFSP57053 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2BFSP57053 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2BFSP57053 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2BFSP57053 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2BFSP57053 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2BFSP57053 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2BFSP57053 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2BFSP57053 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
H2BFSP57053 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2BFSP57053 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2BFSP57053 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2BFSP57053 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2BFSP57053 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2BFSP57053 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2BFSP57053 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2BFSP57053 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2BFSP57053 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2BFSP57053 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2BFSP57053 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2BFSP57053 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2BFSP57053 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2BFSP57053 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2BFSP57053 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2BFSP57053 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2BFSP57053 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2BFSP57053 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2BFSP57053 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2BFSP57053 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2BFSP57053 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2BFSP57053 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2BFSP57053 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2BFSP57053 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2BFSP57053 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2BFSP57053 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2BFSP57053 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2BFSP57053 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2BFSP57053 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2BFSP57053 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2BFSP57053 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2BFSP57053 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2BFSP57053 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
H2BFSP57053 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2BFSP57053 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2BFSP57053 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2BFSP57053 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2BFSP57053 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms