Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAD23AP54725 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAD23AP54725 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAD23AP54725 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAD23AP54725 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAD23AP54725 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAD23AP54725 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAD23AP54725 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAD23AP54725 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAD23AP54725 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAD23AP54725 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAD23AP54725 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAD23AP54725 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAD23AP54725 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAD23AP54725 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAD23AP54725 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAD23AP54725 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAD23AP54725 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAD23AP54725 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAD23AP54725 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
RAD23AP54725 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAD23AP54725 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAD23AP54725 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAD23AP54725 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAD23AP54725 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAD23AP54725 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAD23AP54725 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAD23AP54725 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAD23AP54725 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAD23AP54725 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAD23AP54725 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAD23AP54725 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAD23AP54725 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAD23AP54725 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAD23AP54725 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAD23AP54725 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAD23AP54725 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAD23AP54725 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAD23AP54725 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAD23AP54725 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAD23AP54725 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAD23AP54725 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAD23AP54725 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAD23AP54725 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAD23AP54725 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAD23AP54725 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAD23AP54725 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAD23AP54725 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAD23AP54725 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAD23AP54725 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAD23AP54725 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAD23AP54725 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAD23AP54725 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAD23AP54725 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAD23AP54725 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
RAD23AP54725 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAD23AP54725 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAD23AP54725 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAD23AP54725 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
RAD23AP54725 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAD23AP54725 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAD23AP54725 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAD23AP54725 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
RAD23AP54725 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAD23AP54725 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAD23AP54725 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAD23AP54725 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAD23AP54725 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAD23AP54725 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAD23AP54725 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAD23AP54725 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAD23AP54725 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAD23AP54725 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAD23AP54725 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAD23AP54725 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAD23AP54725 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAD23AP54725 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAD23AP54725 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAD23AP54725 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAD23AP54725 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAD23AP54725 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAD23AP54725 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAD23AP54725 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAD23AP54725 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAD23AP54725 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAD23AP54725 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAD23AP54725 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAD23AP54725 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAD23AP54725 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAD23AP54725 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAD23AP54725 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAD23AP54725 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAD23AP54725 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAD23AP54725 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAD23AP54725 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAD23AP54725 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAD23AP54725 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAD23AP54725 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAD23AP54725 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAD23AP54725 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms