Protein–RNA interactions for Protein: P52657

GTF2A2, Transcription initiation factor IIA subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A2P52657 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GTF2A2P52657 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
GTF2A2P52657 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GTF2A2P52657 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GTF2A2P52657 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
GTF2A2P52657 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GTF2A2P52657 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GTF2A2P52657 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GTF2A2P52657 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GTF2A2P52657 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GTF2A2P52657 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GTF2A2P52657 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GTF2A2P52657 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GTF2A2P52657 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GTF2A2P52657 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GTF2A2P52657 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GTF2A2P52657 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
GTF2A2P52657 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GTF2A2P52657 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GTF2A2P52657 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GTF2A2P52657 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GTF2A2P52657 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GTF2A2P52657 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GTF2A2P52657 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GTF2A2P52657 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GTF2A2P52657 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
GTF2A2P52657 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GTF2A2P52657 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
GTF2A2P52657 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GTF2A2P52657 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GTF2A2P52657 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GTF2A2P52657 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GTF2A2P52657 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GTF2A2P52657 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GTF2A2P52657 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GTF2A2P52657 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GTF2A2P52657 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
GTF2A2P52657 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GTF2A2P52657 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GTF2A2P52657 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GTF2A2P52657 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GTF2A2P52657 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GTF2A2P52657 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GTF2A2P52657 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GTF2A2P52657 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
GTF2A2P52657 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
GTF2A2P52657 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GTF2A2P52657 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GTF2A2P52657 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GTF2A2P52657 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
GTF2A2P52657 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GTF2A2P52657 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
GTF2A2P52657 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GTF2A2P52657 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GTF2A2P52657 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GTF2A2P52657 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GTF2A2P52657 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GTF2A2P52657 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GTF2A2P52657 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GTF2A2P52657 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GTF2A2P52657 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GTF2A2P52657 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GTF2A2P52657 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GTF2A2P52657 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GTF2A2P52657 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GTF2A2P52657 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GTF2A2P52657 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
GTF2A2P52657 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
GTF2A2P52657 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GTF2A2P52657 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GTF2A2P52657 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GTF2A2P52657 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GTF2A2P52657 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GTF2A2P52657 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTF2A2P52657 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTF2A2P52657 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTF2A2P52657 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTF2A2P52657 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTF2A2P52657 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTF2A2P52657 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTF2A2P52657 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTF2A2P52657 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTF2A2P52657 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTF2A2P52657 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTF2A2P52657 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTF2A2P52657 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
GTF2A2P52657 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTF2A2P52657 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTF2A2P52657 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
GTF2A2P52657 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
GTF2A2P52657 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTF2A2P52657 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTF2A2P52657 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTF2A2P52657 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTF2A2P52657 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTF2A2P52657 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTF2A2P52657 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTF2A2P52657 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTF2A2P52657 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTF2A2P52657 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms