Protein–RNA interactions for Protein: P52209

PGD, 6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGDP52209 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PGDP52209 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PGDP52209 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PGDP52209 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PGDP52209 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PGDP52209 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PGDP52209 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PGDP52209 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PGDP52209 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PGDP52209 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PGDP52209 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PGDP52209 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PGDP52209 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PGDP52209 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PGDP52209 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PGDP52209 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PGDP52209 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PGDP52209 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PGDP52209 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PGDP52209 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PGDP52209 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PGDP52209 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PGDP52209 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PGDP52209 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PGDP52209 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PGDP52209 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PGDP52209 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PGDP52209 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PGDP52209 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PGDP52209 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PGDP52209 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PGDP52209 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PGDP52209 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PGDP52209 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PGDP52209 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PGDP52209 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PGDP52209 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PGDP52209 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PGDP52209 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PGDP52209 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PGDP52209 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PGDP52209 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PGDP52209 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PGDP52209 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PGDP52209 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PGDP52209 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PGDP52209 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PGDP52209 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PGDP52209 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PGDP52209 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PGDP52209 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PGDP52209 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PGDP52209 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PGDP52209 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PGDP52209 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PGDP52209 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PGDP52209 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PGDP52209 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PGDP52209 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PGDP52209 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PGDP52209 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PGDP52209 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PGDP52209 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PGDP52209 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PGDP52209 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PGDP52209 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PGDP52209 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PGDP52209 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PGDP52209 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PGDP52209 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PGDP52209 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PGDP52209 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PGDP52209 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PGDP52209 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PGDP52209 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PGDP52209 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PGDP52209 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PGDP52209 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PGDP52209 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PGDP52209 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PGDP52209 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PGDP52209 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PGDP52209 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PGDP52209 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PGDP52209 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PGDP52209 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PGDP52209 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PGDP52209 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PGDP52209 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PGDP52209 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PGDP52209 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PGDP52209 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PGDP52209 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PGDP52209 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PGDP52209 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PGDP52209 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PGDP52209 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PGDP52209 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PGDP52209 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PGDP52209 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms