Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
SMARCA2P51531 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
SMARCA2P51531 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
SMARCA2P51531 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC33.2■■■□□ 2.91
SMARCA2P51531 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
SMARCA2P51531 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
SMARCA2P51531 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
SMARCA2P51531 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
SMARCA2P51531 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
SMARCA2P51531 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
SMARCA2P51531 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
SMARCA2P51531 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
SMARCA2P51531 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
SMARCA2P51531 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
SMARCA2P51531 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
SMARCA2P51531 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC33.2■■■□□ 2.91
SMARCA2P51531 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
SMARCA2P51531 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.9
SMARCA2P51531 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.9
SMARCA2P51531 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
SMARCA2P51531 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
SMARCA2P51531 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
SMARCA2P51531 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
SMARCA2P51531 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
SMARCA2P51531 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
SMARCA2P51531 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
SMARCA2P51531 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC33.19■■■□□ 2.9
SMARCA2P51531 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
SMARCA2P51531 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
SMARCA2P51531 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
SMARCA2P51531 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
SMARCA2P51531 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.19■■■□□ 2.9
SMARCA2P51531 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
SMARCA2P51531 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
SMARCA2P51531 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC33.18■■■□□ 2.9
SMARCA2P51531 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
SMARCA2P51531 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
SMARCA2P51531 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
SMARCA2P51531 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
SMARCA2P51531 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
SMARCA2P51531 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
SMARCA2P51531 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
SMARCA2P51531 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
SMARCA2P51531 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
SMARCA2P51531 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
SMARCA2P51531 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC33.17■■■□□ 2.9
SMARCA2P51531 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
SMARCA2P51531 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
SMARCA2P51531 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
SMARCA2P51531 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
SMARCA2P51531 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
SMARCA2P51531 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
SMARCA2P51531 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
SMARCA2P51531 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
SMARCA2P51531 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
SMARCA2P51531 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
SMARCA2P51531 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
SMARCA2P51531 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
SMARCA2P51531 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
SMARCA2P51531 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
SMARCA2P51531 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
SMARCA2P51531 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
SMARCA2P51531 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
SMARCA2P51531 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
SMARCA2P51531 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
SMARCA2P51531 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
SMARCA2P51531 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
SMARCA2P51531 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
SMARCA2P51531 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
SMARCA2P51531 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
SMARCA2P51531 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
SMARCA2P51531 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
SMARCA2P51531 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
SMARCA2P51531 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
SMARCA2P51531 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
SMARCA2P51531 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
SMARCA2P51531 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
SMARCA2P51531 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
SMARCA2P51531 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
SMARCA2P51531 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
SMARCA2P51531 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
SMARCA2P51531 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
SMARCA2P51531 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
SMARCA2P51531 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC33.15■■■□□ 2.9
SMARCA2P51531 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
SMARCA2P51531 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
SMARCA2P51531 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
SMARCA2P51531 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
SMARCA2P51531 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC33.15■■■□□ 2.9
SMARCA2P51531 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
SMARCA2P51531 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC33.15■■■□□ 2.9
SMARCA2P51531 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
SMARCA2P51531 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
SMARCA2P51531 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
SMARCA2P51531 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
SMARCA2P51531 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
SMARCA2P51531 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
SMARCA2P51531 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
SMARCA2P51531 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
SMARCA2P51531 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.4 ms