Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ATRXP46100 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ATRXP46100 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATRXP46100 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATRXP46100 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATRXP46100 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATRXP46100 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATRXP46100 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATRXP46100 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATRXP46100 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATRXP46100 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATRXP46100 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATRXP46100 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATRXP46100 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ATRXP46100 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATRXP46100 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATRXP46100 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATRXP46100 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATRXP46100 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATRXP46100 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATRXP46100 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATRXP46100 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATRXP46100 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATRXP46100 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ATRXP46100 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATRXP46100 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATRXP46100 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATRXP46100 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATRXP46100 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATRXP46100 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATRXP46100 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATRXP46100 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATRXP46100 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATRXP46100 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATRXP46100 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATRXP46100 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATRXP46100 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATRXP46100 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATRXP46100 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATRXP46100 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATRXP46100 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATRXP46100 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATRXP46100 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATRXP46100 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATRXP46100 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATRXP46100 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ATRXP46100 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATRXP46100 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATRXP46100 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATRXP46100 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATRXP46100 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATRXP46100 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATRXP46100 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATRXP46100 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATRXP46100 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATRXP46100 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATRXP46100 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATRXP46100 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATRXP46100 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATRXP46100 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATRXP46100 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATRXP46100 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATRXP46100 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATRXP46100 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATRXP46100 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATRXP46100 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATRXP46100 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATRXP46100 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATRXP46100 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATRXP46100 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATRXP46100 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ATRXP46100 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATRXP46100 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ATRXP46100 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATRXP46100 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATRXP46100 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ATRXP46100 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATRXP46100 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATRXP46100 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATRXP46100 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATRXP46100 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATRXP46100 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATRXP46100 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATRXP46100 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATRXP46100 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATRXP46100 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATRXP46100 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ATRXP46100 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATRXP46100 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATRXP46100 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ATRXP46100 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATRXP46100 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATRXP46100 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ATRXP46100 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ATRXP46100 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATRXP46100 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATRXP46100 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATRXP46100 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATRXP46100 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATRXP46100 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms