Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LTBRP36941 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LTBRP36941 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LTBRP36941 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LTBRP36941 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LTBRP36941 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
LTBRP36941 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
LTBRP36941 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
LTBRP36941 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LTBRP36941 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LTBRP36941 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LTBRP36941 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LTBRP36941 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LTBRP36941 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LTBRP36941 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LTBRP36941 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LTBRP36941 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LTBRP36941 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LTBRP36941 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LTBRP36941 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LTBRP36941 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LTBRP36941 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LTBRP36941 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LTBRP36941 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LTBRP36941 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LTBRP36941 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
LTBRP36941 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LTBRP36941 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LTBRP36941 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LTBRP36941 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LTBRP36941 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LTBRP36941 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LTBRP36941 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LTBRP36941 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LTBRP36941 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LTBRP36941 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LTBRP36941 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LTBRP36941 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LTBRP36941 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
LTBRP36941 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LTBRP36941 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LTBRP36941 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LTBRP36941 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LTBRP36941 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LTBRP36941 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
LTBRP36941 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LTBRP36941 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LTBRP36941 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LTBRP36941 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LTBRP36941 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LTBRP36941 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LTBRP36941 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LTBRP36941 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LTBRP36941 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LTBRP36941 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LTBRP36941 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LTBRP36941 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LTBRP36941 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
LTBRP36941 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
LTBRP36941 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LTBRP36941 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LTBRP36941 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
LTBRP36941 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LTBRP36941 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LTBRP36941 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LTBRP36941 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LTBRP36941 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LTBRP36941 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LTBRP36941 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LTBRP36941 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LTBRP36941 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LTBRP36941 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LTBRP36941 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LTBRP36941 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LTBRP36941 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LTBRP36941 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LTBRP36941 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LTBRP36941 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LTBRP36941 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LTBRP36941 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LTBRP36941 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LTBRP36941 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
LTBRP36941 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LTBRP36941 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LTBRP36941 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LTBRP36941 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LTBRP36941 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LTBRP36941 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
LTBRP36941 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LTBRP36941 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LTBRP36941 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
LTBRP36941 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LTBRP36941 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LTBRP36941 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LTBRP36941 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LTBRP36941 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LTBRP36941 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LTBRP36941 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LTBRP36941 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LTBRP36941 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms