Protein–RNA interactions for Protein: P31249

HOXD3, Homeobox protein Hox-D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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HOXD3P31249 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
HOXD3P31249 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
HOXD3P31249 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
HOXD3P31249 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC14.46□□□□□ -0.1
HOXD3P31249 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
HOXD3P31249 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
HOXD3P31249 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
HOXD3P31249 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
HOXD3P31249 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
HOXD3P31249 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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