Protein–RNA interactions for Protein: P30532

CHRNA5, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA5P30532 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHRNA5P30532 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHRNA5P30532 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHRNA5P30532 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHRNA5P30532 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHRNA5P30532 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHRNA5P30532 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHRNA5P30532 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHRNA5P30532 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHRNA5P30532 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHRNA5P30532 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHRNA5P30532 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHRNA5P30532 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHRNA5P30532 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHRNA5P30532 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHRNA5P30532 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHRNA5P30532 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHRNA5P30532 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHRNA5P30532 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHRNA5P30532 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHRNA5P30532 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHRNA5P30532 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHRNA5P30532 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHRNA5P30532 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHRNA5P30532 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHRNA5P30532 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHRNA5P30532 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHRNA5P30532 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHRNA5P30532 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHRNA5P30532 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHRNA5P30532 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHRNA5P30532 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHRNA5P30532 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CHRNA5P30532 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHRNA5P30532 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CHRNA5P30532 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHRNA5P30532 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHRNA5P30532 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHRNA5P30532 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHRNA5P30532 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHRNA5P30532 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHRNA5P30532 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHRNA5P30532 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CHRNA5P30532 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHRNA5P30532 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHRNA5P30532 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHRNA5P30532 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHRNA5P30532 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHRNA5P30532 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHRNA5P30532 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHRNA5P30532 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHRNA5P30532 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHRNA5P30532 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CHRNA5P30532 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHRNA5P30532 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHRNA5P30532 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHRNA5P30532 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHRNA5P30532 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CHRNA5P30532 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHRNA5P30532 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHRNA5P30532 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHRNA5P30532 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CHRNA5P30532 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHRNA5P30532 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHRNA5P30532 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHRNA5P30532 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHRNA5P30532 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHRNA5P30532 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHRNA5P30532 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CHRNA5P30532 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHRNA5P30532 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHRNA5P30532 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHRNA5P30532 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CHRNA5P30532 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHRNA5P30532 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHRNA5P30532 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHRNA5P30532 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHRNA5P30532 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CHRNA5P30532 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHRNA5P30532 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHRNA5P30532 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHRNA5P30532 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHRNA5P30532 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHRNA5P30532 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHRNA5P30532 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHRNA5P30532 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHRNA5P30532 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHRNA5P30532 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHRNA5P30532 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHRNA5P30532 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CHRNA5P30532 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHRNA5P30532 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHRNA5P30532 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHRNA5P30532 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHRNA5P30532 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHRNA5P30532 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHRNA5P30532 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHRNA5P30532 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHRNA5P30532 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHRNA5P30532 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms