Protein–RNA interactions for Protein: P30408

TM4SF1, Transmembrane 4 L6 family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF1P30408 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TM4SF1P30408 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TM4SF1P30408 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TM4SF1P30408 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TM4SF1P30408 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TM4SF1P30408 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TM4SF1P30408 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TM4SF1P30408 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TM4SF1P30408 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TM4SF1P30408 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TM4SF1P30408 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TM4SF1P30408 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TM4SF1P30408 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TM4SF1P30408 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TM4SF1P30408 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TM4SF1P30408 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TM4SF1P30408 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TM4SF1P30408 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TM4SF1P30408 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TM4SF1P30408 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TM4SF1P30408 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TM4SF1P30408 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TM4SF1P30408 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TM4SF1P30408 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TM4SF1P30408 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TM4SF1P30408 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TM4SF1P30408 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TM4SF1P30408 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TM4SF1P30408 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TM4SF1P30408 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TM4SF1P30408 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TM4SF1P30408 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TM4SF1P30408 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TM4SF1P30408 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TM4SF1P30408 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TM4SF1P30408 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TM4SF1P30408 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TM4SF1P30408 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TM4SF1P30408 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TM4SF1P30408 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TM4SF1P30408 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TM4SF1P30408 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TM4SF1P30408 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TM4SF1P30408 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TM4SF1P30408 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TM4SF1P30408 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TM4SF1P30408 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TM4SF1P30408 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TM4SF1P30408 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TM4SF1P30408 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TM4SF1P30408 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TM4SF1P30408 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TM4SF1P30408 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TM4SF1P30408 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TM4SF1P30408 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TM4SF1P30408 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TM4SF1P30408 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TM4SF1P30408 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TM4SF1P30408 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TM4SF1P30408 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TM4SF1P30408 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TM4SF1P30408 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TM4SF1P30408 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TM4SF1P30408 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TM4SF1P30408 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TM4SF1P30408 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TM4SF1P30408 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TM4SF1P30408 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TM4SF1P30408 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TM4SF1P30408 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TM4SF1P30408 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TM4SF1P30408 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TM4SF1P30408 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TM4SF1P30408 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TM4SF1P30408 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TM4SF1P30408 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TM4SF1P30408 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TM4SF1P30408 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TM4SF1P30408 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TM4SF1P30408 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TM4SF1P30408 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TM4SF1P30408 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TM4SF1P30408 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TM4SF1P30408 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TM4SF1P30408 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TM4SF1P30408 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TM4SF1P30408 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TM4SF1P30408 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TM4SF1P30408 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TM4SF1P30408 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TM4SF1P30408 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TM4SF1P30408 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TM4SF1P30408 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TM4SF1P30408 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TM4SF1P30408 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TM4SF1P30408 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TM4SF1P30408 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TM4SF1P30408 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TM4SF1P30408 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TM4SF1P30408 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms