Protein–RNA interactions for Protein: P28300

LOX, Protein-lysine 6-oxidase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXP28300 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LOXP28300 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LOXP28300 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LOXP28300 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LOXP28300 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LOXP28300 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LOXP28300 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LOXP28300 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LOXP28300 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LOXP28300 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LOXP28300 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LOXP28300 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LOXP28300 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LOXP28300 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LOXP28300 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LOXP28300 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LOXP28300 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LOXP28300 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LOXP28300 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LOXP28300 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LOXP28300 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LOXP28300 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LOXP28300 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LOXP28300 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LOXP28300 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LOXP28300 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LOXP28300 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LOXP28300 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LOXP28300 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LOXP28300 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LOXP28300 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LOXP28300 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LOXP28300 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LOXP28300 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LOXP28300 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LOXP28300 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LOXP28300 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LOXP28300 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LOXP28300 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LOXP28300 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LOXP28300 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LOXP28300 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LOXP28300 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LOXP28300 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LOXP28300 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
LOXP28300 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LOXP28300 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LOXP28300 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LOXP28300 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LOXP28300 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LOXP28300 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LOXP28300 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LOXP28300 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LOXP28300 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LOXP28300 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LOXP28300 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LOXP28300 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LOXP28300 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LOXP28300 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LOXP28300 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
LOXP28300 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LOXP28300 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LOXP28300 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LOXP28300 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LOXP28300 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
LOXP28300 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
LOXP28300 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
LOXP28300 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LOXP28300 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LOXP28300 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LOXP28300 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LOXP28300 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LOXP28300 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LOXP28300 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LOXP28300 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LOXP28300 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LOXP28300 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LOXP28300 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LOXP28300 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LOXP28300 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LOXP28300 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LOXP28300 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LOXP28300 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LOXP28300 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LOXP28300 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LOXP28300 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LOXP28300 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LOXP28300 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LOXP28300 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LOXP28300 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LOXP28300 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LOXP28300 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LOXP28300 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LOXP28300 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LOXP28300 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LOXP28300 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LOXP28300 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LOXP28300 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LOXP28300 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LOXP28300 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms